当前解析结果
SmilChr02G001356| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001356 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001356 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001356 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 25338398 - 25340206 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008186 |
|---|---|
| GeneID | 131008186 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008186 |
| 原始查询 | SmilChr02G001356 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=30.8; qcov=0.123; evalue=4.79e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008186 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057791062.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057791062.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057791062.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057791062.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791062.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:25338410 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr2:25338445 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C86 |
Chr2:25338460 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr2:25338775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C30 |
Chr2:25338808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B3,B42,B47,C56,C6 |
Chr2:25338811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B36,B78,C70 |
Chr2:25338826 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A2,A24,A5,B104,B11,B114,B134,B17,B26,B39,B63,B66,B71,B74,B84,B87,B91,B95,C15,C18,C4,C43,C44,C55,C77 |
Chr2:25338827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,C79,C84 |
Chr2:25338917 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,C12,C71,C78 |
Chr2:25338946 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B5,B93 |
Chr2:25338967 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C43 |
Chr2:25338975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,C52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。