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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001367`

染色体: Chr02 坐标: 25759521-25760583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001367`
名称	SmilChr02G001367
描述	uncharacterized SmilChr02G001367
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	25759521 - 25760583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008193`
GeneID	`131008193`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008193`
原始查询	`SmilChr02G001367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828253]; symbol=AT4G21660; hit=AT4G21660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828253]; symbol=AT4G21660; hit=AT4G21660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21660` (AT4G21660) proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828253] identity=72.5; qcov=1.04; evalue=2.25e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0827300` - identity=77.5; qcov=0.956; evalue=4.43e-75; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005684 (U2-type spliceosomal complex); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF04046 (PSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008193

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791068.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791068.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057791068.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791068.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:25759620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:25759634`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	182	A1,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B103,B104,B107,B110,B111,B112,B113,B114,B119,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B132,B134,B136,B14,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B62,B63,B68,B7,B71,B72,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C76,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr2:25759677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B136,B91,C33
`Chr2:25759682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:25759682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:25759846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,D8
`Chr2:25759850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B42,B43
`Chr2:25759864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:25759865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:25759868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr2:25759901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,C18,C69,D8
`Chr2:25759930`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A16,A19,A20,A23,A5,B1,B127,B135,B136,B26,B35,B42,B53,B60,B64,B7,B77,B79,B91,B92,B94,B97,C13,C30,C33,C40,C5,C52,C57,C61,C80,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791068.1

181 aa

181

PSP

PF04046 PSP 4-47 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791068.1`	Pfam	`PF04046`	PSP	Family	4	47	1.4e-22	79.9	PSP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935085.1
ATGAAGCTAGGGACATTGTCACATGAGTTAAAAGAGGCTCTAGGCATGCCTGATGGTGCCCCCCCACCATGGCTCATCAATATGCAGAGATATGGTCATCCACCTTCTTATCCTCATTTAAAAATCCCTGGCCTTAATGCACCAATCCCCGCTGGAGCTAGATTTGGCTATGGGCATGGAGAATGGGGCAAACCACCTGTTGATGAATATGGACGTCCCCTCTATGGAGATGTTTTCGGCTTTGTGCAACAAGAACAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008193
ATGAAGCTAGGGACATTGTCACATGAGTTAAAAGAGGCTCTAGGCATGCCTGATGGTGCCCCCCCACCATGGCTCATCAATATGCAGAGATATGGTCATCCACCTTCTTATCCTCATTTAAAAATCCCTGGCCTTAATGCACCAATCCCCGCTGGAGCTAGATTTGGCTATGGGCATGGAGAATGGGGCAAACCACCTGTTGATGAATATGGACGTCCCCTCTATGGAGATGTTTTCGGCTTTGTGCAACAAGAACAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791068.1
MKLGTLSHELKEALGMPDGAPPPWLINMQRYGHPPSYPHLKIPGLNAPIPAGARFGYGHGEWGKPPVDEYGRPLYGDVFGFVQQEQPNYEEEPVDKTKHWGDLEEEEEEEEEEEEEEEEEEQMAEEELEDGIQSVDSLSSTPTGVETPDVIDLRKQQRKEPDRPLYQVIIFLFSLHCYTLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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