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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001408`

染色体: Chr02 坐标: 26713667-26715983 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001408`
名称	SmilChr02G001408
描述	uncharacterized SmilChr02G001408
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	26713667 - 26715983 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007706`
GeneID	`131007706`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007706`
原始查询	`SmilChr02G001408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0492G09.27-1; symbol=P0492G09.27-1; hit=Os01g0935700; species=rice; confidence=weak
产物	P0492G09.27-1; symbol=P0492G09.27-1; hit=Os01g0935700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G27240` (AT3G27240) Cytochrome C1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822343] identity=83.3; qcov=0.286; evalue=5.76e-11; confidence=weak
Rice	`Os01g0935700` (P0492G09.27-1) - identity=83.3; qcov=0.286; evalue=6.06e-12; confidence=weak
GO	GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF02167 (Cytochrom_C1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007706

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790623.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057790623.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790624.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790623.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:26714047`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	67	A13,A2,A20,A21,A22,A3,A7,B11,B114,B115,B118,B120,B123,B138,B139,B19,B20,B22,B26,B28,B29,B40,B44,B47,B49,B5,B52,B53,B55,B56,B57,B62,B64,B71,B74,B75,B82,B85,B88,B89,B9,B90,B95,B99,C15,C24,C36,C37,C49,C5,C52,C56,C57,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C83,C86,C9,D2,D3,D4
`Chr2:26714049`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	67	A13,A2,A20,A21,A22,A3,A7,B11,B114,B115,B118,B120,B123,B138,B139,B19,B20,B22,B26,B28,B29,B40,B44,B47,B49,B5,B52,B53,B55,B56,B57,B62,B64,B71,B74,B75,B82,B85,B88,B89,B9,B90,B95,B99,C15,C24,C36,C37,C49,C5,C52,C56,C57,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C83,C86,C9,D2,D3,D4
`Chr2:26714056`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A13,A2,A20,A21,A22,A3,A7,B11,B114,B115,B118,B120,B123,B138,B139,B19,B20,B22,B28,B29,B44,B47,B49,B5,B52,B53,B55,B56,B57,B62,B64,B71,B74,B75,B82,B88,B89,B9,B90,B95,B99,C24,C36,C37,C49,C5,C52,C56,C57,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C83,C86,C9,D3,D4
`Chr2:26714599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B11,C71
`Chr2:26714605`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C42,C64
`Chr2:26714605`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C42,C64
`Chr2:26714610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B127,B38
`Chr2:26714611`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B123,B17,B74,D11
`Chr2:26714611`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B123,B17,B74,D11
`Chr2:26714645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:26714698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A9,B106,B126,B129,B136,B139,B47,B84,B93,C24,C4,C65
`Chr2:26714737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790623.1

106 aa

106

Cytochrom_C1

PF02167 Cytochrom_C1 50-82 aa

XP_057790624.1

105 aa

105

Cytochrom_C1

PF02167 Cytochrom_C1 50-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790623.1`	Pfam	`PF02167`	Cytochrom_C1	Family	50	82	9.5e-08	32.7	Cytochrome C1 family
`XP_057790624.1`	Pfam	`PF02167`	Cytochrom_C1	Family	50	82	9.5e-08	32.7	Cytochrome C1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096204.1
TCACCTTCACGTCACTCGTTTCTTCGCTGGATCGCCGCCTTCTTGTCGCCTCGAATCGCCACCAACACCGTCGGCATCAGCAGCAAGCGCCATCGCAATCTCTACTCCATCCAACGGAGACGACTATCCTCCTTAGCATGAGCCTCTGTATTTGATCTTGATGGCAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCTTTTTTCCAAGCATGG...

XR_009096205.1
TCACCTTCACGTCACTCGTTTCTTCGCTGGATCGCCGCCTTCTTGTCGCCTCGAATCGCCACCAACACCGTCGGCATCAGCAGCAAGCGCCATCGCAATCTCTACTCCATCCAACGGAGACGACTATCCTCCTTAGCATGAGCCTCTGTATTTGATCTTGATGGCAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCTTTTTTCCAAGCATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007706
ATGAGCTTGCTACTTGTTTCCCCAAGTATACTTCATCAGTTGCCAAAAGAAATTTGGAAAATTTCTCAGGCTGCTCCGTTGCTTTTTTCCAAGCATGGTCAAGCTGAATCAGGATCTACTAGTACAAAGTTTTTCAAGATATTTGCACTTTTTGGTGATCGTCTTCCTCAGCCTTATGCAAACAACCAAGATGCAAGATTTGCAAATGGAGGGGCCTATCCTCCTAATTTAAGTCTTATCACAAAGATTATCCGAGACCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790623.1
MSLLLVSPSILHQLPKEIWKISQAAPLLFSKHGQAESGSTSTKFFKIFALFGDRLPQPYANNQDARFANGGAYPPNLSLITKIIRDHLTRLPASMKNVERFIMGQV

XP_057790624.1
MSLLLVSPSILHQLPKEIWKISQAAPLLFSKHGQAESGSTSTKFFKIFALFGDRLPQPYANNQDARFANGGAYPPNLSLITKIIRDHLTRLPASMKNVERFMFEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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