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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001413`

染色体: Chr02 坐标: 26761991-26762626 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001413`
名称	SmilChr02G001413
描述	uncharacterized SmilChr02G001413
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	26761991 - 26762626 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008202`
GeneID	`131008202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008202`
原始查询	`SmilChr02G001413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825798]; symbol=AT4G04650; hit=AT4G04650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825798]; symbol=AT4G04650; hit=AT4G04650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G04650` (AT4G04650) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825798] identity=31.2; qcov=0.834; evalue=2.84e-19; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.4; qcov=0.701; evalue=3.48e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791077.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791077.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057791077.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791077.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:26762010`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A9,B101,B64,C19,C31
`Chr2:26762010`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A9,B101,B64,C19,C31
`Chr2:26762012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D3,D6
`Chr2:26762041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C83,D3
`Chr2:26762043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B130,D3
`Chr2:26762086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B23,B61,C44
`Chr2:26762095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B121,B24,B27,B63
`Chr2:26762101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B51,B71
`Chr2:26762104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B13,B55
`Chr2:26762110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B137,B40,C44
`Chr2:26762131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B126,B51,B71
`Chr2:26762135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791077.1

211 aa

106

211

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 36-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791077.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	36	120	5e-22	79.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935094.1
ATGCCGATTCCATCTCAAGCGGCTTGGGTGGTGAAGAAAATATTGGGAGCCAGAGACTATATGGCTACACTTCCTGACGGTGACACTCTGATGGAGCAAGACAACTTTTCCATCAAAAAGCTCTATATAGCATTGAGAGGCACTCCGGAGAAAAGGAACTGGCATCATATGATCAGTAAAAGCATAGCTGCGCCAAAGTGTCTCTTCATCTTATGGTTAGCTATTATGAAGAGGATGACAACATGTGATAGACTGCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008202
ATGCCGATTCCATCTCAAGCGGCTTGGGTGGTGAAGAAAATATTGGGAGCCAGAGACTATATGGCTACACTTCCTGACGGTGACACTCTGATGGAGCAAGACAACTTTTCCATCAAAAAGCTCTATATAGCATTGAGAGGCACTCCGGAGAAAAGGAACTGGCATCATATGATCAGTAAAAGCATAGCTGCGCCAAAGTGTCTCTTCATCTTATGGTTAGCTATTATGAAGAGGATGACAACATGTGATAGACTGCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791077.1
MPIPSQAAWVVKKILGARDYMATLPDGDTLMEQDNFSIKKLYIALRGTPEKRNWHHMISKSIAAPKCLFILWLAIMKRMTTCDRLQKFGIQCDQACCLCSQGNESLNHLFFLCPYSAKVWDKFAMWCGVQRKAGAWDDEVEYLERQGASKTGKQLMYRLLVATIVYHIWRERNERRFNSKASHEESVVRQCQLMMVVRGELNPKVHKMFVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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