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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001423`

染色体: Chr02 坐标: 26829970-26830536 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001423`
名称	SmilChr02G001423
描述	uncharacterized SmilChr02G001423
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	26829970 - 26830536 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008206`
GeneID	`131008206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008206`
原始查询	`SmilChr02G001423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG00750; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	hit=ATMG00750; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`ATMG00750` - identity=58.6; qcov=0.154; evalue=4.72e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791081.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791081.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791081.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791081.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:26830003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A4,B10,B106,B2,B21,B49,B66,B95,C17,C2,C34,C52,C6,C76,C82
`Chr2:26830012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	155	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B129,B130,B132,B134,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B92,B95,B99,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C21,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C38,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C84,C86,D1,D11,D2,D4,D5
`Chr2:26830015`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A3,B111,B133,B2,B21,B32,B34,B42,B43,B45,B5,B52,B7,B73,B84,B86,B90,B91,B94,C11,C12,C26,C28,C45,C59,C61,C7,C72,C84,D10,D8
`Chr2:26830028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr2:26830062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B125
`Chr2:26830066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	108	A1,A13,A16,A18,A20,A22,A23,A3,A4,A5,A9,B1,B100,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B112,B114,B115,B119,B121,B123,B128,B129,B13,B133,B137,B138,B140,B15,B20,B21,B28,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B47,B48,B5,B52,B53,B56,B57,B59,B64,B68,B7,B76,B8,B81,B82,B86,B9,B90,B91,B92,B93,B96,B98,C1,C10,C15,C2,C22,C23,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C37,C38,C39,C46,C48,C50,C57,C58,C59,C61,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C77,C78,C80,C81,C82,C84,D10,D2,D5,D8
`Chr2:26830100`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A11,A13,A16,A23,A4,A9,B1,B100,B104,B106,B115,B117,B125,B136,B139,B19,B2,B20,B23,B24,B28,B3,B31,B35,B4,B43,B44,B48,B5,B59,B6,B61,B65,B75,B77,B8,B81,B85,B86,B90,B91,B95,B98,C10,C16,C17,C18,C21,C27,C28,C3,C30,C35,C36,C37,C39,C42,C43,C46,C50,C51,C52,C54,C59,C60,C61,C64,C66,C67,C76,C77,C80,C82,C83,C85,D11,D6,D9
`Chr2:26830108`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B133,B21,B32,B34,B53,B86,B90,C72,D8
`Chr2:26830114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:26830145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B32,C26,D8
`Chr2:26830147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B75
`Chr2:26830154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A23,B18,B28,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791081.1

188 aa

188

Integrase_H2C2

PF17921 Integrase_H2C2 118-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791081.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	118	166	5.4e-11	43.2	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935098.1
ATGAAGAAAAAATTCATGGAATTCAAAATAGAACAGATTTCTCGAGAAGAGAACACCCGGGCAGATTTATTGGCACGAGTTGCCAGTGCAGTGGAACAAACGTGGAGTGATGAGATTACGCTGCTCTGTGACTACAGAGAAATGGGGACTTCCCAGGTTCTTGCGGTGGAAATTCGGGATTATTGGCGGACTCCAATTATACACTTTCTTAAGACAGGGGAGCGACTGAACAAAGAATCCAATCAGAGGGCTCGATACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008206
ATGAAGAAAAAATTCATGGAATTCAAAATAGAACAGATTTCTCGAGAAGAGAACACCCGGGCAGATTTATTGGCACGAGTTGCCAGTGCAGTGGAACAAACGTGGAGTGATGAGATTACGCTGCTCTGTGACTACAGAGAAATGGGGACTTCCCAGGTTCTTGCGGTGGAAATTCGGGATTATTGGCGGACTCCAATTATACACTTTCTTAAGACAGGGGAGCGACTGAACAAAGAATCCAATCAGAGGGCTCGATACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791081.1
MKKKFMEFKIEQISREENTRADLLARVASAVEQTWSDEITLLCDYREMGTSQVLAVEIRDYWRTPIIHFLKTGERLNKESNQRARYKNYCLINEQLYKPSFTHPLLKCLSPEEANFALTEIHAGCCGGHTGFRDLIRKTIRAGFYWPTITKDAREFICKCEACQRHAGKINVPGETMGIMYAACPFDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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