当前解析结果
SmilChr02G001425| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001425 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001425 |
| 描述 | ADP,ATP carrier protein 1, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 26915291 - 26916539 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008207 |
|---|---|
| GeneID | 131008207 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008207 |
| 原始查询 | SmilChr02G001425 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ADP,ATP carrier protein 1, chloroplastic-like |
| 产物 | ADP%2CATP carrier protein 1%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT1G80300 (NTT1)nucleotide transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844370] identity=83.8; qcov=0.751; evalue=4.08e-80; confidence=high |
| Rice | Os02g0208100 (OsNTT2)- identity=80.6; qcov=0.709; evalue=2.29e-67; confidence=high |
| GO | GO:0005471 (ATP:ADP antiporter activity); GO:0006862 (nucleotide transport); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03219 (TLC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008207 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057791082.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057791082.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057791082.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057791082.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791082.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:26915625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B133,B43,B90,B92 |
Chr2:26915721 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C45,D8 |
Chr2:26916111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr2:26916185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791082.1PF03219
TLC 3-138 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791082.1 |
Pfam | PF03219 |
TLC | Family | 3 | 138 | 4.5e-50 | 171.6 | TLC ATP/ADP transporter |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。