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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001429`

染色体: Chr02 坐标: 27003991-27005371 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001429`
名称	SmilChr02G001429
描述	uncharacterized SmilChr02G001429
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27003991 - 27005371 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008208`
GeneID	`131008208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008208`
原始查询	`SmilChr02G001429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543]; symbol=AT5G35695; hit=AT5G35695; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543]; symbol=AT5G35695; hit=AT5G35695; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=57.4; qcov=0.503; evalue=5.73e-70; confidence=medium
Rice	`Os08g0106900` - identity=36.2; qcov=0.86; evalue=1.75e-60; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791083.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057791083.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057791083.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791083.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791083.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27004011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr2:27004031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:27004035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B73,C38,D10
`Chr2:27004053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B45,B72
`Chr2:27004067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B82,C1
`Chr2:27004082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B106,B109,B111,B121,B138,B20,B6,B86,C43,C60,C69,D4
`Chr2:27004110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:27004113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B72
`Chr2:27004113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:27004140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,B99
`Chr2:27004146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr2:27004158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C39,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791083.1

392 aa

196

392

DUF8040

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 71-161 aa PF13359 DDE_Tnp_4 191-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791083.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	71	161	1.6e-22	79.9	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057791083.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	191	315	2.2e-16	60.6	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935100.1
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAATCGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGTTCATGCCAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTCTATTGGGGAATATGATGACGCATCATCCGACTGCTGACAACGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCATTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008208
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAATCGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGTTCATGCCAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTCTATTGGGGAATATGATGACGCATCATCCGACTGCTGACAACGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCATTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791083.1
MNYEDKINIAIEEDIDEELEDEIETEMEIELSVHARQLMEAAKVVITLLGNMMTHHPTADNALMRRPKTREGFHFITRMMDGDPSQFRQLYRMYPDVFIKLCQIIREKAHVDDTRYTTVEEMLATFLIIVGHNDRYCNVRNRFGRSHFATSQNFNKILRALNTIAPDMMVKPTGAIPAKIRESTRFYPYFKFIYVLSGWEGSAHDSKILSDALSRTNGLHVPQGKYFLVHCGFANRRQFLAPLRGVRYHLKDFGGDGRNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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