当前解析结果
SmilChr02G001435| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001435 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001435 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001435 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 27049682 - 27054230 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007702 |
|---|---|
| GeneID | 131007702 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007702 |
| 原始查询 | SmilChr02G001435 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007702 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790618.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790618.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790618.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790618.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790618.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:27049761 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 59 | A13,A15,A23,A25,A4,A6,A8,B10,B103,B105,B108,B114,B117,B119,B121,B126,B128,B134,B20,B21,B42,B45,B46,B47,B54,B55,B59,B60,B66,B7,B71,B73,B76,B79,B8,B81,B90,B93,C12,C15,C20,C3,C31,C32,C33,C35,C38,C45,C50,C54,C55,C59,C60,C63,C68,C77,C80,C82,D9 |
Chr2:27049786 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C58 |
Chr2:27049791 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr2:27050019 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C71 |
Chr2:27050024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C71 |
Chr2:27050025 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。