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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001450`

染色体: Chr02 坐标: 27181809-27183323 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001450`
名称	SmilChr02G001450
描述	S-locus-specific glycoprotein S6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27181809 - 27183323 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007699`
GeneID	`131007699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007699`
原始查询	`SmilChr02G001450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	S-locus-specific glycoprotein S6-like
产物	S-locus-specific glycoprotein S6-like
Arabidopsis	`AT4G21380` (RK3) receptor kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827890] identity=34.7; qcov=1.02; evalue=2.17e-32; confidence=low
Rice	`Os03g0556600` - identity=36.9; qcov=1.02; evalue=3.78e-35; confidence=medium
GO	GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00954 (S_locus_glycop)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057790614.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057790614.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790614.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790614.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27182323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C56
`Chr2:27182344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B105,B20,C56
`Chr2:27182359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A8,B105,B20,C56
`Chr2:27182366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A8,B105,B20,C56
`Chr2:27182620`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	109	A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A5,A7,B100,B101,B107,B108,B113,B115,B117,B119,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B133,B136,B17,B19,B27,B28,B30,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B58,B59,B6,B62,B65,B66,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B78,B80,B84,B85,B87,B89,B94,B98,C1,C11,C12,C16,C17,C18,C20,C22,C23,C25,C27,C3,C31,C37,C39,C43,C44,C47,C5,C52,C53,C54,C61,C67,C69,C7,C73,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C9,D10,D11,D4,D8
`Chr2:27182626`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	82	A11,A13,A15,A19,A2,A21,A24,A25,A5,A7,B101,B108,B115,B117,B123,B126,B128,B130,B131,B136,B17,B27,B28,B30,B36,B38,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B50,B51,B52,B53,B58,B62,B65,B66,B70,B72,B74,B78,B80,B84,B85,B87,B89,B94,B98,C1,C11,C12,C17,C18,C20,C22,C23,C25,C3,C37,C39,C43,C44,C47,C5,C52,C54,C61,C67,C73,C8,C80,C81,C82,C83,C86,C9,D10,D11,D4
`Chr2:27182724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790614.1

192 aa

192

S_locus_glycop

PF00954 S_locus_glycop 50-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790614.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	50	157	4e-23	82.8	S-locus glycoprotein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934631.1
TTTGTTATGATGCTTACGGCTCTTGAGCTCCTCCGTTTTAATTTCTTTTCATTTTTGAACAATATGGCGAATGTGATGTTCACCAAGATCATCTATTTGCTGTCTTTGTTAATCATGTTTCTAAGAATCACTTTTTCAATAGATACACTTCTCCCGAACCAAACAATTGGCATTGGGCAGACTTTGGTTAGTGAAAACCAAATTTTCGAGTTGCATTTTTTCAGCCCTGGAAAATCCAGAAATGTGTTCTTGGGAATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007699
ATGAAACTGGTGGCGGATGATGGCGGCAGAGAGGCATATTTGACATCATGGAGAAACTCCGACGATCCTTCGCCTGGCGATATTGTTTTCAGGATCGTAAATCAGGGCATGCCGGAGCTGGTGGCTTACAGAGGGGAGAACAAAGTGTTCCGAAGTGGACAGTGGAACGGGATTCGCTTTAGCAGCTCGCCACCTTCCGACAACACAATTTTCAAAGCTAAGTTTGAGTTTAGGGGAGACAGGTTGATATCTATGACTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790614.1
MKLVADDGGREAYLTSWRNSDDPSPGDIVFRIVNQGMPELVAYRGENKVFRSGQWNGIRFSSSPPSDNTIFKAKFEFRGDRLISMTRSYESSIVVRSKLDASGELQRLTMNSKGVMWTHVMSFPQDKCGEYGHCGPYAICRIEKVQRCECFSGFKPVSQNDWERQHWYGGCRRVEALNCEGGDDFLKVEGLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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