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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001451`

染色体: Chr02 坐标: 27186625-27188045 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001451`
名称	SmilChr02G001451
描述	uncharacterized SmilChr02G001451
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27186625 - 27188045 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007701`
GeneID	`131007701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007701`
原始查询	`SmilChr02G001451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790616.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057790617.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790616.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790616.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790616.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27187158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr2:27187468`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B118,B61
`Chr2:27187468`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B118,B61
`Chr2:27187469`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B118,B61
`Chr2:27187518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:27187536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:27187626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B14,B22,B69
`Chr2:27187626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B22,B69
`Chr2:27187639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C59
`Chr2:27187733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B87
`Chr2:27187852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C25,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790616.1

169 aa

169

DUF8566

PF29561 DUF8566 117-168 aa

XP_057790617.1

163 aa

163

DUF8566

PF29561 DUF8566 111-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790616.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	117	168	3.2e-14	53.9	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057790617.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	111	162	4e-14	53.6	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934634.1
ATCTGCTATTATAATCTCATATCTGTTTCACCATCCGGTTCGTTTTCACGGTAGGAAGGATGGATCCCAAAAAGCTTAAAGCTCCAGATTCACCAATGGAGAAGCTCCGCTCTCCTGCCAAGAAGCGGACCAAAGCTATGCACCCACGAGTTTCTGTTAGTGATAAAGGGAAGTCTAAAACTAGCATGGTTGCTACTTTTAGTGGGTCATCTTCCGTGGGTGCGAAGAGGAATTTGAATAAGGATATGTTCCAGTTTGTT...

XM_057934633.1
TTTTGGTAGCAGTTTCAATAGTGAAGCAAGAGAGCGACTGCGTTATTATCGTACCCGATAACCTATCGTATATTTGTATATCTTATGCGTAAACAAGTATTTATATATCTTGTTTTATGTGTTTTAATAGATTCACCAATGGAGAAGCTCCGCTCTCCTGCCAAGAAGCGGACCAAAGCTATGCACCCACGAGTTTCTGTTAGTGATAAAGGGAAGTCTAAAACTAGCATGGTTGCTACTTTTAGTGGGTCATCTTCCGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007701
ATGGATCCCAAAAAGCTTAAAGCTCCAGATTCACCAATGGAGAAGCTCCGCTCTCCTGCCAAGAAGCGGACCAAAGCTATGCACCCACGAGTTTCTGTTAGTGATAAAGGGAAGTCTAAAACTAGCATGGTTGCTACTTTTAGTGGGTCATCTTCCGTGGGTGCGAAGAGGAATTTGAATAAGGATATGTTCCAGTTTGTTCCCAGAAATCCATCAATTAATCTTGTTGACTTGACAAATTCAAACGAACGTAGTTGCTC...

LOC131007701
ATGCGTAAACAAGTATTTATATATCTTGTTTTATGTGTTTTAATAGATTCACCAATGGAGAAGCTCCGCTCTCCTGCCAAGAAGCGGACCAAAGCTATGCACCCACGAGTTTCTGTTAGTGATAAAGGGAAGTCTAAAACTAGCATGGTTGCTACTTTTAGTGGGTCATCTTCCGTGGGTGCGAAGAGGAATTTGAATAAGGATATGTTCCAGTTTGTTCCCAGAAATCCATCAATTAATCTTGTTGACTTGACAAATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790616.1
MRKQVFIYLVLCVLIDSPMEKLRSPAKKRTKAMHPRVSVSDKGKSKTSMVATFSGSSSVGAKRNLNKDMFQFVPRNPSINLVDLTNSNERSCSTDVIKPPVMKVNSRRNNKGPKFNTRTTPAAFHDSLRKLNEAQKNAVREIGFGRILDLKLKDLPRHLAYWILNKFNS

XP_057790617.1
MDPKKLKAPDSPMEKLRSPAKKRTKAMHPRVSVSDKGKSKTSMVATFSGSSSVGAKRNLNKDMFQFVPRNPSINLVDLTNSNERSCSTDVIKPPVMKVNSRRNNKGPKFNTRTTPAAFHDSLRKLNEAQKNAVREIGFGRILDLKLKDLPRHLAYWILNKFNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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