当前解析结果
SmilChr02G001455| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001455 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001455 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001455 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 27222988 - 27224878 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008216 |
|---|---|
| GeneID | 131008216 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008216 |
| 原始查询 | SmilChr02G001455 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00860- identity=33.1; qcov=0.416; evalue=2.89e-14; confidence=low |
| Rice | Os08g0202300- identity=39; qcov=0.405; evalue=1.79e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008216 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057791091.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057791091.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791091.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791091.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791091.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:27222992 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C18 |
Chr2:27223009 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B37 |
Chr2:27223015 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B37,B42 |
Chr2:27223022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr2:27223051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B26 |
Chr2:27223051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr2:27223063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,C41,D1 |
Chr2:27223104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B137,B79 |
Chr2:27223161 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C27,C37,C43 |
Chr2:27223235 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B45 |
Chr2:27223244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B137,B33,B79 |
Chr2:27223261 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,B127 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。