当前解析结果
SmilChr02G001464| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001464 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001464 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001464 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 27360610 - 27361345 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008218 |
|---|---|
| GeneID | 131008218 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008218 |
| 原始查询 | SmilChr02G001464 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008218 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791094.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057791094.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791094.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791094.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791094.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:27360629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C66 |
Chr2:27360638 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B76,B8 |
Chr2:27360647 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:27360650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A16,A3,B127,B135,B23,B32,B64,B67,B91,B95,B98,C30,C72,D5 |
Chr2:27360717 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr2:27360730 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B53,B72 |
Chr2:27360751 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C41 |
Chr2:27360751 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr2:27360761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,B22 |
Chr2:27360765 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C21,C81 |
Chr2:27360765 |
CT |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C21,C81 |
Chr2:27360780 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B24,B26,B83,C40,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。