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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001466`

染色体: Chr02 坐标: 27390573-27391778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001466`
名称	SmilChr02G001466
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27390573 - 27391778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008219`
GeneID	`131008219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008219`
原始查询	`SmilChr02G001466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
Arabidopsis	`AT4G27300` (AT4G27300) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828838] identity=66.1; qcov=0.531; evalue=2.68e-42; confidence=medium
Rice	`Os04g0632901` - identity=47.5; qcov=0.867; evalue=5.21e-43; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008219

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791095.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791095.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791095.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791095.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27390647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C47,C8
`Chr2:27390683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:27390685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B37
`Chr2:27390685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:27390763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:27390828`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	97	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A4,A7,A9,B1,B104,B107,B108,B109,B112,B113,B117,B121,B123,B124,B126,B13,B133,B136,B15,B16,B2,B20,B22,B29,B33,B34,B36,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B68,B7,B71,B72,B74,B76,B80,B83,B87,B89,B96,B97,C10,C12,C14,C18,C19,C23,C27,C28,C3,C32,C39,C41,C46,C47,C48,C50,C52,C53,C54,C55,C59,C60,C65,C68,C7,C70,C74,C78,C8,C82,C83,C9,D1,D3,D8,D9
`Chr2:27390847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A1,A15,A16,A19,A4,A8,B1,B100,B107,B108,B109,B112,B117,B123,B125,B13,B133,B136,B15,B26,B29,B36,B38,B39,B42,B43,B45,B47,B48,B51,B52,B55,B56,B59,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B87,B89,B96,B97,B99,C10,C12,C14,C18,C19,C2,C23,C24,C28,C3,C32,C39,C46,C50,C52,C54,C55,C59,C60,C62,C65,C68,C70,C80,C82,D3,D8,D9
`Chr2:27390968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B104,C47,C8
`Chr2:27390987`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A15,A16,A4,A8,B1,B100,B102,B108,B109,B117,B121,B125,B13,B133,B136,B139,B140,B15,B25,B29,B38,B39,B45,B48,B55,B56,B59,B68,B7,B70,B71,B75,B76,B89,B90,B92,B96,B97,B99,C12,C13,C14,C19,C2,C21,C23,C24,C28,C32,C4,C50,C54,C55,C59,C62,C68,C70,C80,C82,D8,D9
`Chr2:27390999`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr2:27390999`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr2:27391579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791095.1

211 aa

106

211

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 123-207 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 125-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791095.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	123	207	1.4e-14	54.9	Protein kinase domain
`XP_057791095.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	125	207	2.5e-16	60.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935112.1
ATGATCTTTCCCGGTGATTGGGACATTCAAGATTGGTCTGGTGGATGCGGGAGAGTAGCAAGGGTGGCGGTGGAGGTGGAGATGGATTTCTTGAGCTGCACCGCCTATGTTAATCCCTACGTGACTGGGCTGCGTCTTGTGGTTTGGGGATCTTATATTGGCACCAATTTGGATAAAGAGCATAAGAAGAAATTGGCTATAAAGTTGATATCAGCATCACTTGTTGTTGGAGTCCTTATCGCAAGCATTATCAATGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008219
ATGATCTTTCCCGGTGATTGGGACATTCAAGATTGGTCTGGTGGATGCGGGAGAGTAGCAAGGGTGGCGGTGGAGGTGGAGATGGATTTCTTGAGCTGCACCGCCTATGTTAATCCCTACGTGACTGGGCTGCGTCTTGTGGTTTGGGGATCTTATATTGGCACCAATTTGGATAAAGAGCATAAGAAGAAATTGGCTATAAAGTTGATATCAGCATCACTTGTTGTTGGAGTCCTTATCGCAAGCATTATCAATGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791095.1
MIFPGDWDIQDWSGGCGRVARVAVEVEMDFLSCTAYVNPYVTGLRLVVWGSYIGTNLDKEHKKKLAIKLISASLVVGVLIASIINGGILYLTRRKWRVKAKDEDIDLPTIKMAALVEATNNFSSENMIGSGGLGSVYKGKLSTGQEIAVKRLSRGSNQGVEEFKNEIKLIAKLQHRNLVRLVGCCIQGEEMVLIYEYLQHKSLDCFISGAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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