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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001472`

染色体: Chr02 坐标: 27465732-27468531 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001472`
名称	SmilChr02G001472
描述	uncharacterized SmilChr02G001472
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27465732 - 27468531 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007697`
GeneID	`131007697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007697`
原始查询	`SmilChr02G001472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10950 (Organ_specific)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790612.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790612.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790612.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790612.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27467742`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	86	A10,A13,A15,A16,A2,A24,A25,A8,B103,B105,B106,B108,B111,B113,B114,B117,B119,B120,B122,B125,B127,B128,B13,B135,B16,B18,B2,B20,B27,B28,B3,B32,B35,B36,B38,B44,B52,B58,B59,B6,B62,B63,B65,B66,B70,B78,B8,B89,B9,B91,B94,C1,C18,C20,C22,C24,C29,C34,C38,C4,C41,C43,C45,C47,C49,C51,C54,C55,C56,C6,C63,C66,C67,C68,C72,C74,C77,C8,C83,C87,C9,D1,D3,D4,D6,D7
`Chr2:27467744`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	67	A15,A16,A20,A23,A4,A8,B108,B113,B117,B121,B125,B129,B13,B133,B135,B139,B14,B15,B16,B2,B20,B29,B32,B38,B45,B55,B56,B59,B6,B68,B69,B71,B75,B76,B77,B80,B89,B90,B92,B96,C2,C21,C24,C29,C33,C4,C46,C49,C50,C51,C52,C54,C59,C62,C63,C64,C66,C68,C7,C72,C74,C78,C9,D10,D11,D3,D8
`Chr2:27467810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:27468189`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr2:27468189`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr2:27468194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790612.1

211 aa

106

211

Organ_specific

PF10950 Organ_specific 27-62 aa PF10950 Organ_specific 60-126 aa PF10950 Organ_specific 92-158 aa PF10950 Organ_specific 124-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790612.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	27	62	1.5e-22	81.2	Organ specific protein
`XP_057790612.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	60	126	1.5e-22	81.2	Organ specific protein
`XP_057790612.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	92	158	1.5e-22	81.2	Organ specific protein
`XP_057790612.1`	Pfam	`PF10950`	Organ_specific	Family	124	190	1.5e-22	81.2	Organ specific protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934629.1
GAATGTATTTGTAATTTTAAGAAATAAGAGGAACATTTTCGTAGATTGATCAAACCTCAAGGCTATGTTTGCAATTATTGAGGCTCTTTGTTCATTTAGTTGTATTTTCTTTCTATAAAAGGCACCTATCATTTTTGTTTCTTTAGTTGTATTTTCCTTCATTAAAAGGCAAATAACAATTAGTATCAAACTGAGAGAGAGAACTATGAGATCCCTGTGCTTTATCGCCACTGTGTGTCTTGCCGTGCTTGCACGAGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007697
ATGAGATCCCTGTGCTTTATCGCCACTGTGTGTCTTGCCGTGCTTGCACGAGTTAACAATGCAAGAAAAGATCCAGCGCAGCATGAACCAAGGCCGAGTGTTATTGCCTATGTGGATGGTCACAAGCCCACGAGTGAGAAATCTTTTGTAAAAGATTTTGAGCCAAGATCCGATTTTTTTCCTTATGATAAATATGCCAATCTTAATGTGGATGGTCACAAGCCCACGGGTGAGAAATCTTTTGTAAAAGATTTTGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790612.1
MRSLCFIATVCLAVLARVNNARKDPAQHEPRPSVIAYVDGHKPTSEKSFVKDFEPRSDFFPYDKYANLNVDGHKPTGEKSFVKDFEPRSDFFPYDKYANLNVDGHKPTGEKSFVKDFEPRSDFFPYDKYANLNVDGHKPTGEKSFVKDFEPRSDFFPYDKYANLNVDGHKSTGEKSFVKDFEPRSDFFPYDKYANINVDGHKPTGEESFVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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