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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001493`

染色体: Chr02 坐标: 27883223-27885551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001493`
名称	SmilChr02G001493
描述	uncharacterized SmilChr02G001493
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27883223 - 27885551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008223`
GeneID	`131008223`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008223`
原始查询	`SmilChr02G001493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0646700` - identity=44.3; qcov=0.147; evalue=9.63e-27; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N); PF23343 (REP_ORF2-G2P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008223

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791099.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057791099.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057791099.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791099.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27883230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:27883347`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C2
`Chr2:27883347`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C2
`Chr2:27883392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr2:27883407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr2:27883457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr2:27883789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:27883818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:27883957`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B2,B84,B91,C28
`Chr2:27883957`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B2,B84,B91,C28
`Chr2:27884011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:27884019`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791099.1

661 aa

330

661

Helitron_like_N

REP_ORF2-G2P

PF14214 Helitron_like_N 3-134 aa PF23343 REP_ORF2-G2P 60-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791099.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	3	134	2.1e-46	159.3	Helitron helicase-like domain at N-terminus
`XP_057791099.1`	Pfam	`PF23343`	REP_ORF2-G2P	Domain	60	146	1.2e-06	29.4	Replication-associated protein ORF2/G2P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935116.1
ATGAGAGCAGAATTATATCAAGGAATTGTTGATAGTGTTTACAAAGGAGAATTGAGAGGAAATGAAGTTGGCAAAAGAATTGTTCTTCCTGCAACATTTATCGGGGGTCCAAGAGATATGAGGCGTAGATATCTTGATGCATTGGCATTAGTACAAAGATTCGGAAAACCAGATTTATTTATTACAATGACATGCAACCCGGAATGGAAGGAAATACAAGAAAACTTATATGTTGGTCAAACAGCTCAAGATCGTCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008223
ATGAGAGCAGAATTATATCAAGGAATTGTTGATAGTGTTTACAAAGGAGAATTGAGAGGAAATGAAGTTGGCAAAAGAATTGTTCTTCCTGCAACATTTATCGGGGGTCCAAGAGATATGAGGCGTAGATATCTTGATGCATTGGCATTAGTACAAAGATTCGGAAAACCAGATTTATTTATTACAATGACATGCAACCCGGAATGGAAGGAAATACAAGAAAACTTATATGTTGGTCAAACAGCTCAAGATCGTCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791099.1
MRAELYQGIVDSVYKGELRGNEVGKRIVLPATFIGGPRDMRRRYLDALALVQRFGKPDLFITMTCNPEWKEIQENLYVGQTAQDRPDLTARVFRAKLQDLRDQLFKNEIFGHVAAHVHVIEFQKRGLPHVHMLIIFKSENKINTTDEIDKFVSAELPDEEKNPELFDLVKKQMMHGPCGEKNPKNSCMVKEKCKCHYPRSYCESTIQGKDEYPIYRRQDNGSFIRVRNADLDNRWVVPYNAYLLSRYNCHINVEVCSGIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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