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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G001500

染色体: Chr02 坐标: 28041638-28043989 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G001500
名称SmilChr02G001500
描述cysteine-rich receptor-like protein kinase 25
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向28041638 - 28043989 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131007705
GeneID131007705
locus_tag-
NCBI NameLOC131007705
原始查询SmilChr02G001500

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述cysteine-rich receptor-like protein kinase 25
产物cysteine-rich receptor-like protein kinase 25
ArabidopsisAT4G21380 (RK3)
receptor kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827890]
identity=31.3; qcov=0.95; evalue=1.66e-08; confidence=low
RiceOs02g0210700
-
identity=40.2; qcov=0.678; evalue=2.87e-10; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131007705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cell membrane 细胞膜 1.00000 XP_057790621.1
2 Endoplasmic reticulum 内质网 0.20000 XP_057790621.1
3 Vacuole 液泡 0.20000 XP_057790621.1
4 Vacuole membrane 液泡膜 0.20000 XP_057790621.1
5 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057790621.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr2:28043309 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B37
Chr2:28043816 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B27,B53,B67,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XR_009096201.1
TTTTATCACATCTCTTAAATAAATCAACAAATCTTTTTTTCCATCCATTCCACTTAGTTGGATAATCAAACAAACCAGAGCTTATTTGAATCGCATAAATCGACAAGCTCATGGTGTTGATTGCTTAATTGGTGGTCCCGGTGGTCCACGCTGTTAGCAAAATAATGGGCAACGGAGACACGTTTGCATTGTACATCCATCACAGAGGTAGCTTTGGAAATACAGGGAAGCATGTTGTGTACACAGGAGGTAATTTTGAG...
XR_009096202.1
TTTTATCACATCTCTTAAATAAATCAACAAATCTTTTTTTCCATCCATTCCACTTAGTTGGATAATCAAACAAACCAGAGCTTATTTGAATCGCATAAATCGACAAGCTCATGGTGTTGATTGCTTAATTGGTGGTCCCGGTGGTCCACGCTGTTAGCAAAATAATGGGCAACGGAGACACGTTTGCATTGTACATCCATCACAGAGGTAGCTTTGGAAATACAGGGAAGCATGTTGTGTACACAGGAGGTAATTTTGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131007705
ATGGGCAACGGAGACACGTTTGCATTGTACATCCATCACAGAGGTAGCTTTGGAAATACAGGGAAGCATGTTGTGTACACAGGAGATATTGGCACCAATTTGGATAAAGAGGATAAGAAGAAATTGGCTATAAAGTTGATATCAGCATCACTTGCTGTTGGAGTCCTTGTGGCAAGCTTTATCAATGGAGGGATACTCTATCTGACGAGGCGAAAGTGGCGAGTAAAAGCAAAAGATGAGGATATAGATTTGCCTACAAT...
LOC131007705
ATGGGCAACGGAGACACGTTTGCATTGTACATCCATCACAGAGGTAGCTTTGGAAATACAGGGAAGCATGTTGTGTACACAGGAGATATTGGCACCAATTTGGATAAAGAGGATAAGAAGAAATTGGCTATAAAGTTGATATCAGCATCACTTGCTGTTGGAGTCCTTGTGGCAAGCTTTATCAATGGAGGGATACTCTATCTGACGAGGCGAAAGTGGCGAGTAAAAGCAAAAGATGAGGATATAGATTTGCCTACAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057790621.1
MGNGDTFALYIHHRGSFGNTGKHVVYTGDIGTNLDKEDKKKLAIKLISASLAVGVLVASFINGGILYLTRRKWRVKAKDEDIDLPTIKMAALVEATNNFSSENMIGSGGFGSVYKIRSEGCF
XP_057790622.1
MGNGDTFALYIHHRGSFGNTGKHVVYTGDIGTNLDKEDKKKLAIKLISASLAVGVLVASFINGGILYLTRRKWRVKAKDEDIDLPTIKMAALVEATNNFSSENMIGSGGFGSVYKVICIPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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