当前解析结果
SmilChr02G001500| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001500 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001500 |
| 描述 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 25 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 28041638 - 28043989 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007705 |
|---|---|
| GeneID | 131007705 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007705 |
| 原始查询 | SmilChr02G001500 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 25 |
| 产物 | cysteine-rich receptor-like protein kinase 25 |
| Arabidopsis | AT4G21380 (RK3)receptor kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827890] identity=31.3; qcov=0.95; evalue=1.66e-08; confidence=low |
| Rice | Os02g0210700- identity=40.2; qcov=0.678; evalue=2.87e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007705 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057790621.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057790621.1 |
| 3 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057790621.1 |
| 4 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057790621.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790621.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:28043309 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
Chr2:28043816 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B53,B67,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。