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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001507`

染色体: Chr02 坐标: 28091874-28093255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001507`
名称	SmilChr02G001507
描述	uncharacterized SmilChr02G001507
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28091874 - 28093255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008229`
GeneID	`131008229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008229`
原始查询	`SmilChr02G001507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822665]; symbol=AT3G29763; hit=AT3G29763; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822665]; symbol=AT3G29763; hit=AT3G29763; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29763` (AT3G29763) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822665] identity=53.9; qcov=0.721; evalue=3.7e-70; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=37; qcov=0.764; evalue=7.41e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791104.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791104.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791104.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791104.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791104.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28092583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C24,C33,C83
`Chr2:28093238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:28093247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:28093252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,C3,C41,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791104.1

301 aa

150

301

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

DUF4371

PF14291 DUF4371 72-142 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 136-224 aa PF14291 DUF4371 139-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791104.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	72	142	1.8e-65	221.5	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057791104.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	136	224	4.8e-08	33.6	FAM200/ZBED5 RNase-like
`XP_057791104.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	139	219	1.8e-65	221.5	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935121.1
ATGGAACGCTATTATTCGAAAGCATCTCCCAAGGTAGATGTTCCATCTTCATCAGTGAATGAACATCCTCAAATATTACCAAAGGAAGTGAGCATTGGAGTTGATTCTCCACCTCAAGCATCAACAAAGGGAATGAATATTGAAATCGATTTAGAAAATCTTCCAAGTGATCCGGGACTACGACTTGATATAATGAGCTATCCACCAAATTTAATTGAATTGAATGCTTCGGTTGTTTGTCTTCGCTATCTTATTATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008229
ATGGAACGCTATTATTCGAAAGCATCTCCCAAGGTAGATGTTCCATCTTCATCAGTGAATGAACATCCTCAAATATTACCAAAGGAAGTGAGCATTGGAGTTGATTCTCCACCTCAAGCATCAACAAAGGGAATGAATATTGAAATCGATTTAGAAAATCTTCCAAGTGATCCGGGACTACGACTTGATATAATGAGCTATCCACCAAATTTAATTGAATTGAATGCTTCGGTTGTTTGTCTTCGCTATCTTATTATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791104.1
MERYYSKASPKVDVPSSSVNEHPQILPKEVSIGVDSPPQASTKGMNIEIDLENLPSDPGLRLDIMSYPPNLIELNASVVCLRYLIMQGLAFRGKDESERSLNQGNFIELLKVVASCNEDISKVVLKNAPDNLKLTSPDIQIDECRDVSVKEQMGVVIRYVDKNGCVIERFLGLVHVSDTASTSLEMGIDSLFSTHGLSVSSLRGQGYDGASNMRGEFNGLKSLILKRTPSAYYVHYFAHQLQLTIVAVAKNIQVLGHFLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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