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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001515`

染色体: Chr02 坐标: 28260562-28262682 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001515`
名称	SmilChr02G001515
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28260562 - 28262682 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008232`
GeneID	`131008232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008232`
原始查询	`SmilChr02G001515`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.6; qcov=0.823; evalue=2.68e-87; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=27.2; qcov=0.821; evalue=3.04e-69; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791108.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791108.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791108.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791108.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28260921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B78,C64
`Chr2:28260952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C80,C81
`Chr2:28260953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,C19,C36,C74
`Chr2:28260973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C62,C81
`Chr2:28261023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:28261025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C74
`Chr2:28261065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:28261155`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B64
`Chr2:28261155`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B64
`Chr2:28261161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:28261169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C39
`Chr2:28261212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A25,B1,B103,B136,B139,B87,C29,C5,C66,C68,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791108.1

666 aa

333

666

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 2-81 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 173-274 aa PF10551 MULE 203-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791108.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	2	81	6.5e-12	46.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057791108.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	173	274	1.3e-07	32.3	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057791108.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	203	293	5.2e-26	91.6	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935125.1
TTCATTAGATGATGGTGAAAAGTTTTATATGGCTTATGCTAAGCGTTGTGGATTTAAGTCGCGTCTTGGTGCTGTTAAGCGTAAGAAATCTGGGGTGATTATTTCTAGACTTATTTTTTGTAGTCGGGAAGGGTTGAGTAAATCTGGTGGAAATATTAGATCTAGGATGAGTACAAGAGTAGATTGCAAAGCTCGTATTATTCTTCGTGTTGTTGATGGTGGTTCTTACACTATTGTGAATTTTATTGAGGGTCATAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008232
ATGGCTTATGCTAAGCGTTGTGGATTTAAGTCGCGTCTTGGTGCTGTTAAGCGTAAGAAATCTGGGGTGATTATTTCTAGACTTATTTTTTGTAGTCGGGAAGGGTTGAGTAAATCTGGTGGAAATATTAGATCTAGGATGAGTACAAGAGTAGATTGCAAAGCTCGTATTATTCTTCGTGTTGTTGATGGTGGTTCTTACACTATTGTGAATTTTATTGAGGGTCATAGTCATCGATTTGTTTCAGATAATCTTCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791108.1
MAYAKRCGFKSRLGAVKRKKSGVIISRLIFCSREGLSKSGGNIRSRMSTRVDCKARIILRVVDGGSYTIVNFIEGHSHRFVSDNLQHFMLSNRKLDHGHKKFVLNCVKTNIGPVKSFHLFKKLVGGYDKVGCTAVDFKNFARDLRAYVLGSDAQILLNNLFNKREICSDFQFEYAVDSSDKLTRLFWADPLSIQKYDAFGESVSFDATYSTNRYNLIFVPFTGKDNHGSCVTFGAGLISHEDEESYSWVLEKFVECMRRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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