当前解析结果
SmilChr02G001521| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001521 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001521 |
| 描述 | diacylglycerol kinase 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 28319377 - 28325595 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007681 |
|---|---|
| GeneID | 131007681 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007681 |
| 原始查询 | SmilChr02G001521 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | diacylglycerol kinase 1-like |
| 产物 | diacylglycerol kinase 1-like |
| Arabidopsis | AT2G20900 (DGK5)diacylglycerol kinase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816624] identity=66.5; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os04g0634700 (OsBIDK1)- identity=70; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004143 (ATP-dependent diacylglycerol kinase activity); GO:0007205 (GO:0007205) |
| KEGG | smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00609 (DAGK_acc); PF00781 (DAGK_cat) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007681 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790597.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057790597.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057790597.1 |
| 4 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.20000 | XP_057790597.1 |
| 5 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057790597.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:28322005 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:28323169 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr2:28324021 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D3 |
Chr2:28324444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:28325366 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B105,B84,C43,C58 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790597.1PF00781
DAGK_cat 63-187 aa
PF00609
DAGK_acc 255-429 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790597.1 |
Pfam | PF00781 |
DAGK_cat | Family | 63 | 187 | 1.7e-20 | 73.6 | Diacylglycerol kinase catalytic domain |
XP_057790597.1 |
Pfam | PF00609 |
DAGK_acc | Family | 255 | 429 | 4.1e-37 | 128.7 | Diacylglycerol kinase accessory domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。