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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001524`

染色体: Chr02 坐标: 28372223-28372725 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001524`
名称	SmilChr02G001524
描述	uncharacterized SmilChr02G001524
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28372223 - 28372725 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007709`
GeneID	`131007709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007709`
原始查询	`SmilChr02G001524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Wound-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826618]; symbol=AT4G10265; hit=AT4G10265; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Wound-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826618]; symbol=AT4G10265; hit=AT4G10265; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G10265` (AT4G10265) Wound-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826618] identity=62.4; qcov=1; evalue=1.01e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0635100` - identity=51.7; qcov=1.02; evalue=4.29e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12609 (DUF3774)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790627.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057790627.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790627.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790627.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28372403`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D8
`Chr2:28372403`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D8
`Chr2:28372490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B84,C43,C58
`Chr2:28372578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C32
`Chr2:28372599`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	52	A10,A18,A19,A2,A7,B1,B101,B103,B117,B118,B12,B122,B132,B138,B139,B16,B18,B23,B3,B30,B36,B4,B48,B57,B62,B67,B78,B88,B90,B92,B94,C16,C19,C20,C21,C27,C34,C44,C53,C56,C61,C64,C66,C70,C73,C77,C81,D1,D2,D3,D6,D7
`Chr2:28372602`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	52	A10,A18,A19,A2,A7,B1,B101,B103,B117,B118,B12,B122,B132,B138,B139,B16,B18,B23,B3,B30,B36,B4,B48,B57,B62,B67,B78,B88,B90,B92,B94,C16,C19,C20,C21,C27,C34,C44,C53,C56,C61,C64,C66,C70,C73,C77,C81,D1,D2,D3,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790627.1

85 aa

DUF3774

PF12609 DUF3774 10-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790627.1`	Pfam	`PF12609`	DUF3774	Family	10	84	3.8e-30	105.5	Wound-induced protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934644.1
TACAATACCACTTTAAATCTGCGGACTCCCCTTTTTGGGTCGGCGGTGAAACCAACCAATCCACCCCCAGTTTCCCTAACTCAACACGCACTATATATATACTTTCCACTATCACAATCTCATCCTTCTTCATACTCTTCAATCCCAACCCTAATTTATCCGATCCCCAAATCAAAATGAGTTCGTCAAGCAGAGCTTGGGCAGTAGCAGCGAGCGTTGGGGTCGTGGAGGCGCTCAAAGATCAGGGCGTCTGCCGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007709
ATGAGTTCGTCAAGCAGAGCTTGGGCAGTAGCAGCGAGCGTTGGGGTCGTGGAGGCGCTCAAAGATCAGGGCGTCTGCCGATGGAATTATGCTTTCCGGCTTCTCCAGCAGCAAGCCAACACCAATCTCAGATCTTACATTCAAGCTAAGAAACTCTCGCCTGCAGTCATGGCGACAACGAGGCAACAAGATAAGTCGAAGCAATCGGAGGAGTCTCTTAGAACTGTCATGTATCTCAGCTCTTGGGCTCCCAATTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790627.1
MSSSSRAWAVAASVGVVEALKDQGVCRWNYAFRLLQQQANTNLRSYIQAKKLSPAVMATTRQQDKSKQSEESLRTVMYLSSWAPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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