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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001531`

染色体: Chr02 坐标: 28562341-28566261 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001531`
名称	SmilChr02G001531
描述	uncharacterized SmilChr02G001531
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28562341 - 28566261 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007746`
GeneID	`131007746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007746`
原始查询	`SmilChr02G001531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	membrane lipoprotein lipid attachment site-like protein, putative (DUF1223) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835512]; symbol=AT5G54240; hit=AT5G54240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	membrane lipoprotein lipid attachment site-like protein, putative (DUF1223) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835512]; symbol=AT5G54240; hit=AT5G54240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54240` (AT5G54240) membrane lipoprotein lipid attachment site-like protein, putative (DUF1223) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835512] identity=56.2; qcov=1.06; evalue=1.15e-117; confidence=high
Rice	`Os07g0559400` - identity=50; qcov=1.04; evalue=1.77e-93; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06764 (DUF1223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790633.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790633.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790633.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790633.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790633.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28562666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr2:28562715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B140
`Chr2:28562844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D3
`Chr2:28562873`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C26,C28,C9
`Chr2:28562873`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C26,C28,C9
`Chr2:28564520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:28564577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B22,C18
`Chr2:28564597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B90,C18
`Chr2:28564598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B22,B90,C18
`Chr2:28564606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B90,C18
`Chr2:28564682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr2:28564703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790633.1

266 aa

133

266

DUF1223

PF06764 DUF1223 37-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790633.1`	Pfam	`PF06764`	DUF1223	Family	37	247	7e-60	203.3	Protein of unknown function (DUF1223)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934650.1
TTTCGATTGTAGTAGCCTTGATTTTACAAATCAGTAAGAAAAATCTAGATAGAGAAAGAAAGGGTGATGTGAAGGATAAGAGGGTTTAGCGACTGCAGAATCTGGGGGTGGTGTGGTTTCCACCCACGAGAGCTACACGGCTACTTCGGCTTCTATAGCAGAAGAGTATCAATTGCTAAAAACTCAAACAGTATTCACACAGAGAAAGATGAAGAAGGAGCCGTACAAGGACACGTGGGAAGGACTAGAGGAGAAACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007746
ATGGCGCCCCGTCTCTTGAGCTGTTTCAGGCGGCGACCCTCCGGCGACCCCCACCGCGAGACCGATAAGGTGACGGCGGAGGAGCAGCGTGGAGAAGGCGGGCCGGTGGTGGTGGAGCTGTTCTCGTCGCAGGGGTGCGCGAGCTCGCCGGAGGCGGAGCTGCTGTTCTCGCGACTGGGGAGGGGCGATTTCCCGGTGGAGGCGCCGTTGATACTGTTGGGGTATCACGTGGACATCTGGGATTATATGGGGTGGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790633.1
MAPRLLSCFRRRPSGDPHRETDKVTAEEQRGEGGPVVVELFSSQGCASSPEAELLFSRLGRGDFPVEAPLILLGYHVDIWDYMGWKDPFGSSQWTVRQKAYVEALQLDTMFTPQIVVQGHAQCIANDEDAMLSCIASAPTFPAPSFQARFEKPTPESLQVTLTGALRSNVDHDGVNVMVALYDSGLVTDCSGGVNKGRVLANDYVVRRLEKLCSVKDISAKKTLSGTLNFPLWEGFNAAKCGLAVFLETPSHRILGSQSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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