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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001534`

染色体: Chr02 坐标: 28600076-28600906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001534`
名称	SmilChr02G001534
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28600076 - 28600906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013378`
GeneID	`131013378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013378`
原始查询	`SmilChr02G001534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
产物	dynein light chain 1%2C cytoplasmic
Arabidopsis	`AT4G27360` (AT4G27360) Dynein light chain type 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828844] identity=77.4; qcov=0.823; evalue=4.06e-50; confidence=medium
Rice	`Os02g0269200` - identity=57.3; qcov=0.788; evalue=3.28e-26; confidence=medium
GO	GO:0007017 (microtubule-based process); GO:0030286 (dynein complex); GO:0045505 (dynein intermediate chain binding); GO:0051959 (dynein light intermediate chain binding)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01221 (Dynein_light)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797427.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797427.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797427.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057797427.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28600550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:28600612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C10,C3,C50
`Chr2:28600646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B140,B49
`Chr2:28600670`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	88	A14,A2,A20,A21,A23,A25,B101,B107,B108,B11,B112,B113,B124,B126,B128,B130,B131,B133,B135,B22,B27,B28,B29,B35,B38,B39,B4,B41,B44,B46,B50,B53,B54,B57,B62,B64,B65,B68,B69,B77,B82,B85,B9,B95,B97,C1,C11,C13,C14,C15,C24,C25,C26,C29,C30,C31,C33,C4,C41,C42,C43,C44,C49,C51,C52,C56,C57,C6,C64,C65,C67,C69,C7,C71,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C82,C83,C85,C9,D10,D11,D3,D4
`Chr2:28600672`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A13,A25,A6,B10,B105,B114,B119,B120,B123,B128,B129,B134,B21,B24,B27,B47,B49,B60,B61,B64,B73,B79,B8,B81,C15,C18,C20,C29,C31,C35,C38,C39,C4,C55,C63,C76,D9
`Chr2:28600679`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	114	A13,A14,A2,A20,A21,A23,A25,A6,B10,B101,B105,B107,B108,B11,B112,B113,B114,B119,B120,B123,B124,B126,B128,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B21,B22,B24,B27,B28,B29,B35,B38,B39,B4,B41,B44,B46,B47,B49,B50,B53,B54,B57,B60,B61,B62,B64,B65,B68,B69,B73,B77,B79,B8,B81,B82,B85,B9,B95,B97,C1,C11,C13,C14,C15,C20,C24,C25,C26,C29,C30,C31,C33,C35,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C49,C51,C52,C55,C56,C57,C6,C63,C64,C65,C67,C69,C7,C71,C73,C74,C76,C77,C79,C80,C82,C83,C85,C9,D10,D11,D4,D9
`Chr2:28600689`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A11,B114,B42,B43,B58,B66,B72,C10,C17,C3,C50,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797427.1

113 aa

113

Dynein_light

PF01221 Dynein_light 5-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797427.1`	Pfam	`PF01221`	Dynein_light	Domain	5	89	6.4e-33	113.7	Dynein light chain type 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941444.1
CACCACATAAAAGGAATCCTCATTTTAGGAATTTAAATCCATATATAGGACCACTCCTCCACGTACAAATAGCAAGCCCACATGAATTGAGATCACCCAGACGAATATTTATTTTCCAAAAGAGGAAGAAGAAGTTGATAAATTTGATCACAATAGTTGAGAAATTATCGATCGAGTATGTTGGAAGGGAAGGCAGTTGTAGGTGAGACTGATATGCTGGAGGCCATGCAGCATGATGCTCTTCATTTAGCAGCTAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013378
ATGTTGGAAGGGAAGGCAGTTGTAGGTGAGACTGATATGCTGGAGGCCATGCAGCATGATGCTCTTCATTTAGCAGCTAAGGCACTCGACTCCTTTGATGTCACTGACGCCACCGAAATTGCTCGATTCATTAAGAAGGAATTTGACAGGATATATGGAAATGGTTGGCAATGTATTGTGGGGACGGACTTTGGTTCATTTGTGACTCATTGCTCAGGCTGTTTCATCCATTTTTGCATAGGCAGTCTTGCTATTTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797427.1
MLEGKAVVGETDMLEAMQHDALHLAAKALDSFDVTDATEIARFIKKEFDRIYGNGWQCIVGTDFGSFVTHCSGCFIHFCIGSLAILLFKGSTALQTESQSQPILEASTLNPKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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