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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001540`

染色体: Chr02 坐标: 28663913-28666472 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001540`
名称	SmilChr02G001540
描述	uncharacterized SmilChr02G001540
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28663913 - 28666472 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011152`
GeneID	`131011152`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011152`
原始查询	`SmilChr02G001540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nicotinamidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816789]; symbol=NIC1; hit=AT2G22570; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nicotinamidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816789]; symbol=NIC1; hit=AT2G22570; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G22570` (NIC1) nicotinamidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816789] identity=34.5; qcov=0.763; evalue=1.95e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25465 (Beta-prop_At4g14310)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011152

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794931.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794931.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057794931.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057794932.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28665061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B49
`Chr2:28665107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B49
`Chr2:28665671`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B77,C48
`Chr2:28665671`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B77,C48
`Chr2:28665673`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr2:28665673`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr2:28665954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,B63,D2
`Chr2:28665958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,B63,D2
`Chr2:28665973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B102,B63,D2
`Chr2:28666023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B49
`Chr2:28666062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B122,B140
`Chr2:28666177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,C16,C38,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794931.1

119 aa

119

Beta-prop_At4g14310

PF25465 Beta-prop_At4g14310 69-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794931.1`	Pfam	`PF25465`	Beta-prop_At4g14310	Repeat	69	119	6.1e-19	69.0	At4g14310 8-bladed propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096768.1
TTTAATAGCTGGCCCACTATTGGTAAAGCTTCCAAGGGAAGCTTAGCATTCAAAAATTTTTGAATTTAGGAGGTGAGTCTCATTTTAGTTTGAACTCGACAAATATTGTGCGAAAAATTGAGGTCGTCATTTTTTTGGTGGAAAGCTTGAAGGAGACTGTGTTCGTCATTTTTCATCAATCTTCACCAAGTTCGTCAGCGACTGCTTTGGGATCCTTGCCGGAGACATCTTCCCGACGTTTGAAGGGTTAGAGTTGGGTC...

XM_057938949.1
TTTTTTAATAGCTGGCCCACTATTGGTAAAGCTTCCAAGGGAAGCTTAGCATTCAAAAATTTTTGAATTTAGGAGGTGAGTCTCATTTTAGTTTGAACTCGACAAATATTGTGCGAAAAATTGAGGTCGTCATTTTTTTGGTGGAAAGCTTGAAGGAGACTGTGTTCGTCATTTTTCATCAATCTTCACCAAGTTCGTCAGCGACTGCTTTGGGATCCTTGCCGGAGACATCTTCCCGACGTTTGAAGGGTTAGAGTTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011152
ATGCTGCTGATAGAGGAAACTCTTCTTCTCTCCGCTGATGTGAAGATCGGATTGGTGCTTGTCGACATCGTTAATGGCTTCTGCACTGTTGGTTCCGGAAATCTCAGATCTCGTGTAAGAACCCTTGCTCCTCTGTCGAACAACACAATGCATGGAAGATTAACTTTGTCTACTGCTATGGCTGTTGAAAACCAACAATGGTGGATTAGTTCAGCAGAAGCAGAAGTCAGCTTTCTCGCTTGGGGATTCCATCTAAATTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794931.1
MLLIEETLLLSADVKIGLVLVDIVNGFCTVGSGNLRSRVRTLAPLSNNTMHGRLTLSTAMAVENQQWWISSAEAEGSDGVFCTSDSINVLDFWQPLGIAFKIPKVGVDVQSAFSLGDSI

XP_057794932.1
MLLIEETLLLSADVKIGLVLVDIVNGFCTVGSGNLRSRVRTLAPLSNNTMHGRLTLSTAMAVENQQWWISSAEAEVSFLAWGFHLNWMFYIKISCEKAILFRNPTVLFAQTKAF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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