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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001551`

染色体: Chr02 坐标: 28792844-28794875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001551`
名称	SmilChr02G001551
描述	uncharacterized SmilChr02G001551
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28792844 - 28794875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013217`
GeneID	`131013217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013217`
原始查询	`SmilChr02G001551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0506000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os07g0506000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21570` (AT4G21570) organic solute transporter ostalpha protein (DUF300) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828242] identity=64.4; qcov=1; evalue=8.65e-139; confidence=high
Rice	`Os07g0506000` - identity=64.1; qcov=0.993; evalue=3.29e-145; confidence=high
GO	GO:0005215 (transporter activity); GO:0006810 (transport)
KEGG	-
Pfam	PF03619 (Solute_trans_a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057797275.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057797275.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057797275.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057797275.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28793366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr2:28793527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:28793614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B98,D11
`Chr2:28793632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:28793635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:28793688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:28793695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:28793747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A7,C81
`Chr2:28793747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C81
`Chr2:28793781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:28793789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:28794128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797275.1

289 aa

144

289

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 9-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797275.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	9	275	5.9e-73	246.2	Organic solute transporter Ostalpha

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941292.1
GTGAGTGAGGAAGTATCCATCACGTCACTTTGATTTTTTTTTTTTTCCATGAAAATTTCACAGCCCGCAATTCTGCGCAAGTTCTTCATTTTATTCTTTCCTCTTTGCTCATAGCGCATGTGTTGAAGAAGAATGAGATAAGATTGTGTGATAGTATGGAAAGCAGCCAAGTGAGTTTGATAGGATCAACCATATGTTTGATGGTAACTCTGCAGCTGTCGATACAGTTAGTATCCCAGCATTACTTATCATGGAACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013217
ATGGAAAGCAGCCAAGTGAGTTTGATAGGATCAACCATATGTTTGATGGTAACTCTGCAGCTGTCGATACAGTTAGTATCCCAGCATTACTTATCATGGAACAACCCCAAAGAGCAGAAGGCCATAGTCGTCATCGTTCTCATGGCTCCCTTGTACGCCATCGACTCCTACGCGGGCTTCATAGTCGTACAAGGGAGCTCCACTTTCTTCACTTTCCTCGACTCTGTCAAAGAGTGCTACGAGGCTCTAGTGATGGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797275.1
MESSQVSLIGSTICLMVTLQLSIQLVSQHYLSWNNPKEQKAIVVIVLMAPLYAIDSYAGFIVVQGSSTFFTFLDSVKECYEALVMAKFLSLMYAYLNISISQNIVPDHIKGREIHHSFPITLFQPHTVRLDHKNLKLLKNWTWQFVVIRPVCSVLMIALQLLGVYPEWLSWTLTVILNVSVSLALYSLVLLHHVFAKELEAHKPLAKFLCIKGIVFFSFWQGMVLDVLVAMGILKSDKLGLDVEHLEEAVENVLVIVEMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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