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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001552`

染色体: Chr02 坐标: 28806600-28807767 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001552`
名称	SmilChr02G001552
描述	uncharacterized SmilChr02G001552
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28806600 - 28807767 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013218`
GeneID	`131013218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013218`
原始查询	`SmilChr02G001552`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835525]; symbol=AT5G54370; hit=AT5G54370; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835525]; symbol=AT5G54370; hit=AT5G54370; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54370` (AT5G54370) Late embryosis abundant (LEA) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835525] identity=55.7; qcov=0.946; evalue=5.83e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0968300` - identity=42.1; qcov=0.844; evalue=1.1e-68; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06830 (Root_cap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057797276.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057797276.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057797276.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797276.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28806958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C1
`Chr2:28807013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:28807132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:28807199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B91,C17
`Chr2:28807275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B120
`Chr2:28807542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:28807550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C10
`Chr2:28807565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B137,B66
`Chr2:28807619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C10
`Chr2:28807627`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,B122,B35,B78,B86,C22,C36,C75,C82
`Chr2:28807646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797276.1

315 aa

158

315

Root_cap

PF06830 Root_cap 250-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797276.1`	Pfam	`PF06830`	Root_cap	Family	250	306	2.4e-24	85.9	Root cap

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941293.1
AATTGGACTTGGTCAAGATTTTTGATTATTCCCTTTGCATTGCATGGAAATAGATAGAGATCTGAAGCTACTTATAAATCACAAAGCATGGGAACTAACTAATTACATCTCATCTTCATCATGAAAATCTTCATCTGCAAATGTGCGTTGATCATCGTGTTGATGCATGCATCCATCCTCCCTCAGAGTCGTGCGCAGAATGGGGAAAGAGTGGTGTGCACCAGCAAAAAGAGCCCATGTTTCCTCAAGGGAATAACCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013218
ATGAAAATCTTCATCTGCAAATGTGCGTTGATCATCGTGTTGATGCATGCATCCATCCTCCCTCAGAGTCGTGCGCAGAATGGGGAAAGAGTGGTGTGCACCAGCAAAAAGAGCCCATGTTTCCTCAAGGGAATAACCTGTCCGAAACAATGCCCGACCCGAAGGCCCACGGACCCCAAGGCGAAGGCGTGCTTCATCAACTGCGACTCTCCCATATGCAAGGCCGAGTGCAGACGCCGGAAGCCCAGCTGCAACGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797276.1
MKIFICKCALIIVLMHASILPQSRAQNGERVVCTSKKSPCFLKGITCPKQCPTRRPTDPKAKACFINCDSPICKAECRRRKPSCNGVGAACYDPRFIGADGAVFYFHGRSNEHFSLVSDSSLHINARFIGHRPSGRSRDYTWIQALGVLFGSHSLSVEAKQAAEWDSSVDHFRFVYDGDEVGLPPGFLSGWRSAEGEVTLERVRSTNSAVVSIPGVVEIGVNVVPITKEDDRIHKYEIPADDCFAHLEVQFRLFDVSAAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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