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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001557`

染色体: Chr02 坐标: 28863841-28865005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001557`
名称	SmilChr02G001557
描述	uncharacterized SmilChr02G001557
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28863841 - 28865005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013221`
GeneID	`131013221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013221`
原始查询	`SmilChr02G001557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acetyl Co-enzyme a carboxylase carboxyltransferase alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818382]; symbol=CAC3; hit=AT2G38040; species=arabidopsis; confidence=low
产物	acetyl Co-enzyme a carboxylase carboxyltransferase alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818382]; symbol=CAC3; hit=AT2G38040; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G38040` (CAC3) acetyl Co-enzyme a carboxylase carboxyltransferase alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818382] identity=66.7; qcov=0.333; evalue=1.21e-16; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003989 (acetyl-CoA carboxylase activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0009317 (acetyl-CoA carboxylase complex); GO:0016743 (carboxyl- or carbamoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03255 (ACCA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057797278.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797278.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797278.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797278.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28863978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr2:28863978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:28864002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B112,B132,C55
`Chr2:28864002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C55
`Chr2:28864021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr2:28864024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B21,B22,C25,D1
`Chr2:28864027`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	60	A13,A20,A21,B10,B107,B109,B12,B121,B123,B125,B126,B130,B18,B21,B23,B26,B27,B32,B33,B38,B54,B58,B6,B60,B61,B64,B65,B70,B71,B72,B74,B83,B89,B91,B98,C10,C17,C21,C24,C29,C41,C43,C45,C46,C47,C49,C51,C53,C59,C62,C63,C64,C67,C68,C70,C8,C80,C9,D4,D7
`Chr2:28864033`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B126,B18,C10,C41
`Chr2:28864033`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B126,B18,C10,C41
`Chr2:28864654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A16,B126,B140,B7,B84,C14,D10
`Chr2:28864663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B22,C25
`Chr2:28864665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797278.1

144 aa

144

ACCA

PF03255 ACCA 8-54 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797278.1`	Pfam	`PF03255`	ACCA	Family	8	54	4.7e-14	53.0	Acetyl co-enzyme A carboxylase carboxyltransferase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941295.1
TGCTGACATTCCTTTGCTCAAGAATCTTTGTCAACAAAAGGATGTAGCCCGAGTGGTTTCAGAAACATGGAATTCCTACTTGAGGATGAAACTGGTGACTGTCATGCATGTCTTTATGTATTATAATGCTCAGGATTCAGTTCGTAGAGCTTCATGGTGATCGAGCTGGATACGATGATCCTGCTGTGTCACCCGTAAATGGCAGAAGCTACATGTTCGTGGGCCATCAGAAGGGAAGGAACACGAAAGAGAATATTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013221
ATGTCTTTATGTATTATAATGCTCAGGATTCAGTTCGTAGAGCTTCATGGTGATCGAGCTGGATACGATGATCCTGCTGTGTCACCCGTAAATGGCAGAAGCTACATGTTCGTGGGCCATCAGAAGGGAAGGAACACGAAAGAGAATATTCAGCGCAACTACCCCTCATGGGCTGCTGAGAAGCTAAAGATAACAGCAACAGAGTTGACAAAGCTGCATATTGGTGATGGCATCATACCTACTAAAGTCATAAACCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797278.1
MSLCIIMLRIQFVELHGDRAGYDDPAVSPVNGRSYMFVGHQKGRNTKENIQRNYPSWAAEKLKITATELTKLHIGDGIIPTKVINQLREPRSGSMSRNRRWNPLAARSRSWPPDKHTFQPASLNREDHCIRYQFREAITKYRGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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