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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001561`

染色体: Chr02 坐标: 28877684-28878106 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001561`
名称	SmilChr02G001561
描述	uncharacterized SmilChr02G001561
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28877684 - 28878106 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008246`
GeneID	`131008246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008246`
原始查询	`SmilChr02G001561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784]; symbol=AT1G47497; hit=AT1G47497; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784]; symbol=AT1G47497; hit=AT1G47497; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G47497` (AT1G47497) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007784] identity=32.5; qcov=0.814; evalue=4.45e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791120.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791120.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791120.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791120.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28877726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B135,C76,D4
`Chr2:28877768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B7,B84,D10
`Chr2:28877780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B7,B84,D10
`Chr2:28877788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B22,C25
`Chr2:28877827`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A9,C3
`Chr2:28877827`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A9,C3
`Chr2:28877831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr2:28877831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:28877867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B7,B84,C58,D10
`Chr2:28877883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:28877901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A23,B30,B77,C29,C33,C49,C6,C64,C66,C74
`Chr2:28877924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A14,A22,A24,A3,A6,A8,B10,B106,B110,B115,B12,B126,B127,B130,B132,B18,B19,B25,B30,B32,B34,B42,B43,B52,B58,B60,B63,B65,B73,B75,B82,B83,B86,B9,B93,B99,C12,C22,C26,C28,C35,C37,C41,C43,C50,C54,C6,C72,C85,C86,C87,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791120.1

140 aa

140

RVT_3

PF13456 RVT_3 4-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791120.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	4	109	2.7e-10	40.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935137.1
ATGATGCATTCAGGCGGGGTTATGCGCAACGCTTTTAATGAAGTGGTGGGTTGTTTTCATTTTACCGGTGGTCCTGGTGCGGCTCTGGAGGCAGAACTTCTTGCGATCATCATTGCTAAAGAGACTACGTACCGTATTGGTTGGCCTCAGGTTTGGTTCGAGTCGGATTTTTCCTTTGTGGTCCGTTTACTGCATTCTCGGGCCTTGACGGTTCCTTGGCGATTCAAGGCGCGTTGGAAGCAAGCTCTTCTCTATGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008246
ATGATGCATTCAGGCGGGGTTATGCGCAACGCTTTTAATGAAGTGGTGGGTTGTTTTCATTTTACCGGTGGTCCTGGTGCGGCTCTGGAGGCAGAACTTCTTGCGATCATCATTGCTAAAGAGACTACGTACCGTATTGGTTGGCCTCAGGTTTGGTTCGAGTCGGATTTTTCCTTTGTGGTCCGTTTACTGCATTCTCGGGCCTTGACGGTTCCTTGGCGATTCAAGGCGCGTTGGAAGCAAGCTCTTCTCTATGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791120.1
MMHSGGVMRNAFNEVVGCFHFTGGPGAALEAELLAIIIAKETTYRIGWPQVWFESDFSFVVRLLHSRALTVPWRFKARWKQALLYASAFTWKISHIFCEGNSAADFMASTGMEVGFWGHASPGLQVIVEDDVRKIYVRLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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