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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001587`

染色体: Chr02 坐标: 29615757-29616318 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001587`
名称	SmilChr02G001587
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29615757 - 29616318 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008256`
GeneID	`131008256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008256`
原始查询	`SmilChr02G001587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT4-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HAT4-like
Arabidopsis	`AT4G16780` (HB-2) homeobox protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827384] identity=74.8; qcov=0.901; evalue=1.5e-78; confidence=high
Rice	`Os04g0548700` (Oshox17) - identity=72.5; qcov=0.845; evalue=8.95e-66; confidence=high
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ); PF04618 (HD-ZIP_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791128.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791128.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791128.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791128.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29615771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B45
`Chr2:29615816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B130
`Chr2:29615830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A11,A3,B101,B91
`Chr2:29615841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B56,D4
`Chr2:29615862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:29615873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:29615907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C86
`Chr2:29615929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B39
`Chr2:29616014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:29616021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr2:29616209`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A16,A25,A4,A6,B117,B120,B123,B124,B129,B132,B24,B25,B41,B50,B54,B59,B65,B69,B70,B77,C13,C17,C20,C22,C28,C36,C4,C52,C6,C63,C65,C70
`Chr2:29616214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B59,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791128.1

181 aa

181

HD-ZIP_N

Homeodomain

HALZ

PF04618 HD-ZIP_N 4-23 aa PF00046 Homeodomain 47-102 aa PF02183 HALZ 104-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791128.1`	Pfam	`PF04618`	HD-ZIP_N	Domain	4	23	6.6e-06	27.3	HD-ZIP protein N terminus
`XP_057791128.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	47	102	1.9e-14	54.0	Homeodomain
`XP_057791128.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	104	136	3.1e-12	47.1	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935145.1
CCATCTCCCACCGTCTCTTCCCCGAACAGCACCATCTCCAGCATCAGCGGCAAGCGCAGCGAGCGCGAAGCCACCGACGACGGCGAGAGGGCTTCCTCCCGCGGCGGCATCAGCGACGAAGAGGACGCCGAGAACGCCAGGAAGAAGCTCCGCCTCTCCAAGGATCAATCCGCCATTCTCGAGGAAAGCTTCAAAGAGCACAACACACTCAATCCAAAGCAAAAAAAAATGGATTTGGCAAAGAGATTGGGGCTGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008256
CCATCTCCCACCGTCTCTTCCCCGAACAGCACCATCTCCAGCATCAGCGGCAAGCGCAGCGAGCGCGAAGCCACCGACGACGGCGAGAGGGCTTCCTCCCGCGGCGGCATCAGCGACGAAGAGGACGCCGAGAACGCCAGGAAGAAGCTCCGCCTCTCCAAGGATCAATCCGCCATTCTCGAGGAAAGCTTCAAAGAGCACAACACACTCAATCCAAAGCAAAAAAAAATGGATTTGGCAAAGAGATTGGGGCTGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791128.1
PSPTVSSPNSTISSISGKRSEREATDDGERASSRGGISDEEDAENARKKLRLSKDQSAILEESFKEHNTLNPKQKKMDLAKRLGLRPMQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRAPKLSPQLYMQMTPPTTLTMCPSCEKVALPSTATALQARSSSCRAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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