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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001589`

染色体: Chr02 坐标: 29620102-29623338 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001589`
名称	SmilChr02G001589
描述	ABC transporter G family member 14-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29620102 - 29623338 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013245`
GeneID	`131013245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013245`
原始查询	`SmilChr02G001589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter G family member 14-like
产物	ABC transporter G family member 14-like
Arabidopsis	`AT1G31770` (ABCG14) ATP-binding cassette 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840064] identity=56.6; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0157400` (OsABCG4) - identity=47.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04981 (Folate transport and metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF01061 (ABC2_membrane); PF19055 (ABC2_membrane_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797300.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057797300.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057797300.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797300.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29620156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C4
`Chr2:29620302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B75,C21
`Chr2:29620544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C3
`Chr2:29622010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:29622025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A18,B101,B110,B135,B17,B21,B25,B65,B66,B8,B9,B99,C12,C35,C74,C84,D3
`Chr2:29622055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D11
`Chr2:29622085`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A15,A25,A7,B100,B103,B106,B113,B120,B129,B131,B137,B140,B17,B22,B27,B29,B31,B32,B34,B48,B49,B60,B63,B64,B65,B66,B8,B9,B90,B92,C17,C18,C2,C34,C43,C54,C55,C69,C72,C80,D3
`Chr2:29622157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,C10,C60,C76
`Chr2:29622175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C60
`Chr2:29622383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:29622397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr2:29622451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797300.1

603 aa

302

603

ABC_tran

ABC2_membrane_7

ABC2_membrane

PF00005 ABC_tran 42-192 aa PF19055 ABC2_membrane_7 221-288 aa PF19055 ABC2_membrane_7 325-594 aa PF01061 ABC2_membrane 337-543 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797300.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	42	192	3.9e-30	106.0	ABC transporter
`XP_057797300.1`	Pfam	`PF19055`	ABC2_membrane_7	Family	221	288	4.7e-19	69.3	ABC-2 type transporter
`XP_057797300.1`	Pfam	`PF19055`	ABC2_membrane_7	Family	325	594	4.7e-19	69.3	ABC-2 type transporter
`XP_057797300.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	337	543	5.7e-41	141.1	ABC-2 type transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941317.1
ATGGATGAATTCCGAATTAATTTGGTTAATAGCATCTGGCTGCAGTTCGAGGATGTTGTATACAAGATCAAACCCCAGCGCTCAGGAATCCTAAAGAGAAGCAAATCAGAAGAGAAAGTAATCCTGAAAGGCATCAGCGGCATTGTGGCGCCGGGCGAGATGCTCGCCCTCCTCGGCCCCTCCGGCAGCGGCAAAACCACCCTCTTAACCGCCCTGGGCGGCCGCCTCGGCGGCAACCTCTCCGGCACCATAACCTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013245
ATGGATGAATTCCGAATTAATTTGGTTAATAGCATCTGGCTGCAGTTCGAGGATGTTGTATACAAGATCAAACCCCAGCGCTCAGGAATCCTAAAGAGAAGCAAATCAGAAGAGAAAGTAATCCTGAAAGGCATCAGCGGCATTGTGGCGCCGGGCGAGATGCTCGCCCTCCTCGGCCCCTCCGGCAGCGGCAAAACCACCCTCTTAACCGCCCTGGGCGGCCGCCTCGGCGGCAACCTCTCCGGCACCATAACCTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797300.1
MDEFRINLVNSIWLQFEDVVYKIKPQRSGILKRSKSEEKVILKGISGIVAPGEMLALLGPSGSGKTTLLTALGGRLGGNLSGTITYNNKPFSNAMKRNTGFVTQDDVLHPHLTVFETLLYTALLRLPKTLTRAEKAEQAEAVISQLGLSRCRDSAVGSHVVRGVSGGERKRVSIGQEMLINPSLLLLDEPTSGLDSTTALRIVATLRELVNGGRTIAMTIHQPSTTLFYLFHKIILLSEGNLLYYGKASVALDYFSTIGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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