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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001603`

染色体: Chr02 坐标: 29869787-29870605 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001603`
名称	SmilChr02G001603
描述	uncharacterized SmilChr02G001603
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29869787 - 29870605 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008261`
GeneID	`131008261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008261`
原始查询	`SmilChr02G001603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=25; qcov=0.574; evalue=3.04e-10; confidence=low
Rice	`Os09g0241700` - identity=32.4; qcov=0.375; evalue=1.76e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791133.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791133.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791133.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791133.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29869806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:29869866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B93,B98
`Chr2:29869899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:29869921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C29,C75
`Chr2:29869923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:29869947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C75
`Chr2:29869948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:29869969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:29870100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:29870219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:29870220`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A4,A7,B102,B108,B113,B135,B140,B32,B45,B49,B5,B65,B80,B91,B99,C11,C14,C69,C74,C80,D8
`Chr2:29870224`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B113,B80,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935150.1
ATGGATGGAGACAATAATTCTTTCTTCAACTCTAAAAATTTCAATCCCTCCCAAGACTATTATCCAAATCTTGCTGATATTCCAAGCTCCAATGAATTCCCAGAGTTTGATTATGCTATGAATTCAGAATTCTCGCATAATCCAACTGATTCTCCTATTTTTGAATATCACCAAACCTCTGAAAATTTTTCTACAAACCACCCTTCCAACAATGCTCAAAGTTGGACTGATATAGAAGATATATCACTAATGTCTGCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008261
ATGGATGGAGACAATAATTCTTTCTTCAACTCTAAAAATTTCAATCCCTCCCAAGACTATTATCCAAATCTTGCTGATATTCCAAGCTCCAATGAATTCCCAGAGTTTGATTATGCTATGAATTCAGAATTCTCGCATAATCCAACTGATTCTCCTATTTTTGAATATCACCAAACCTCTGAAAATTTTTCTACAAACCACCCTTCCAACAATGCTCAAAGTTGGACTGATATAGAAGATATATCACTAATGTCTGCTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791133.1
MDGDNNSFFNSKNFNPSQDYYPNLADIPSSNEFPEFDYAMNSEFSHNPTDSPIFEYHQTSENFSTNHPSNNAQSWTDIEDISLMSAWCFVSNNPIVGTNRNSKSFWKTVAGMYEQSRAANPEIGGRRSIKSLRNRYKRLNKNVTLWVVAYKKVYERRASDQSKEDIEKAAQAIYDKPKFTHHEVFEKVMSSYLNWELKLDSTGYVQRSHPDDEDSVDESRSSSKKLRTDEDVDPTTDSTPETPGSDASKFHRPIGRDKAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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