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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001607`

染色体: Chr02 坐标: 29905772-29907271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001607`
名称	SmilChr02G001607
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29905772 - 29907271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013257`
GeneID	`131013257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013257`
原始查询	`SmilChr02G001607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G24320` (AT4G24320) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828535] identity=50.9; qcov=0.891; evalue=1.52e-115; confidence=high
Rice	`Os03g0646200` - identity=38.8; qcov=0.859; evalue=2.55e-73; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057797310.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057797310.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797310.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797310.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29905910`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B107,C3,C32,C59,C81,D4
`Chr2:29905926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B82,D8
`Chr2:29905970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:29905978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B98,C42
`Chr2:29906109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:29906281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B3,B40,D7
`Chr2:29906284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr2:29906494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B59,B98,C42
`Chr2:29906495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B59,B98,C42
`Chr2:29906542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:29906740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:29906863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797310.1

432 aa

216

432

PORR

PF11955 PORR 56-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797310.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	56	383	1.3e-103	347.2	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941327.1
AAAATATTAGTAATGTCTTTGTGTCCCAAATGAATGAATTTGAAGTACATCTTCCATAAGTTTCCCACAGCAGCAGCAAATGCACAAGTTCAGTGTAATATGCATAACCGATGCTCATACGTCCTCCACTTCGCCACCGCCCGCTTCCGCCTTCGCCTCCGCCACGTCCGCACCTTTATAAACGCCAGAATCAAATGGGTCCGCGACCCCTATCTCGACGCCGCCGTAGAGAGAGAAAAAAATCTCAAATCCCTACACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013257
ATGAATTTGAAGTACATCTTCCATAAGTTTCCCACAGCAGCAGCAAATGCACAAGTTCAGTGTAATATGCATAACCGATGCTCATACGTCCTCCACTTCGCCACCGCCCGCTTCCGCCTTCGCCTCCGCCACGTCCGCACCTTTATAAACGCCAGAATCAAATGGGTCCGCGACCCCTATCTCGACGCCGCCGTAGAGAGAGAAAAAAATCTCAAATCCCTACACTCTCTCAAAAACCTCATCCTCTCTCACCCATCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797310.1
MNLKYIFHKFPTAAANAQVQCNMHNRCSYVLHFATARFRLRLRHVRTFINARIKWVRDPYLDAAVEREKNLKSLHSLKNLILSHPSQSLPLSAISPLKPHLGLPTTADKFIDNYPFIFKIFLPPNRTNPFPHVKITPKALSVHYDELLHLNMSHYRTDVAQRLAKLLMIARAGKLPLHLIDIFGYDLGLPHDYLLTLLPEFPDYFQICDLGFRDSNGEIVFGLELVNWRNDLAISEMEKRGESGMQMKYSMNLPRGFDLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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