当前解析结果
SmilChr02G001608| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001608 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001608 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001608 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 29944973 - 29946511 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008266 |
|---|---|
| GeneID | 131008266 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008266 |
| 原始查询 | SmilChr02G001608 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008266 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791136.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057791136.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057791136.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057791136.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.40000 | XP_057791136.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:29944974 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,C3,C68,D7 |
Chr2:29944981 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B11,B37,B57 |
Chr2:29944993 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B101,B114 |
Chr2:29944993 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B101,B114 |
Chr2:29945000 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,C42,C63 |
Chr2:29945006 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,D11 |
Chr2:29945032 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B1,B114,B55,B56,C11,C4,C45,C69,C86,D5,D8 |
Chr2:29945034 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B55,B61 |
Chr2:29945041 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B45 |
Chr2:29945041 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B45 |
Chr2:29945043 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr2:29945045 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B55,B61 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。