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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001628`

染色体: Chr02 坐标: 30235664-30237252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001628`
名称	SmilChr02G001628
描述	uncharacterized SmilChr02G001628
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30235664 - 30237252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008270`
GeneID	`131008270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008270`
原始查询	`SmilChr02G001628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0537000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G15020` (AT4G15020) hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827161] identity=33.7; qcov=0.868; evalue=2.85e-63; confidence=low
Rice	`Os12g0537000` - identity=36.9; qcov=0.923; evalue=2.04e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791140.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791140.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791140.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791140.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30235670`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B125,B16,B35,B36,B47,B5,B54,C73,C84
`Chr2:30235677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C60
`Chr2:30235688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B133,B90,C55
`Chr2:30235715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B132,B9
`Chr2:30235729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B54,C79
`Chr2:30235757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A3,A9,B103,B104,B128,B22,B30,B35,B36,B53,B66,B85,C15,C42,C50,C55,C59,C8,D10
`Chr2:30235759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B132,B16,B9
`Chr2:30235768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,C55,C60,D5
`Chr2:30235787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B140,B98
`Chr2:30235802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:30235805`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	26	A13,A23,A24,A9,B11,B12,B2,B20,B3,B37,B41,B53,B55,B61,B7,B71,B93,B94,C17,C44,C5,C51,C54,C77,C8,C9
`Chr2:30235808`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A13,A23,A24,A9,B11,B12,B2,B20,B3,B37,B41,B53,B55,B61,B7,B71,B93,B94,C17,C44,C5,C51,C54,C77,C8,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791140.1

441 aa

220

441

DUF659

PF04937 DUF659 124-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791140.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	124	274	3.8e-54	183.1	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935157.1
ATGGATTCGATTCCTCACTTTGATGAGGTAGACAACATGGAGAAAGCAGTAGATGATGAAGTAGACGTTTCACAGGTAAAAGCTCATGGAAAACAGCCATCAGTCGAGGCATCTACAAATTCTGTAGCCTTGAAGAAACCACGGAATATTGGTCGTTTGGATTTGATCTACCAAAAGCTACCAAATGCGAAAAGTTCCAAAACTTCACAATCACAATTTGAAGAAGCTCAAAAGAAGTTAAGGGAGGCTGTCGTTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008270
ATGGATTCGATTCCTCACTTTGATGAGGTAGACAACATGGAGAAAGCAGTAGATGATGAAGTAGACGTTTCACAGGTAAAAGCTCATGGAAAACAGCCATCAGTCGAGGCATCTACAAATTCTGTAGCCTTGAAGAAACCACGGAATATTGGTCGTTTGGATTTGATCTACCAAAAGCTACCAAATGCGAAAAGTTCCAAAACTTCACAATCACAATTTGAAGAAGCTCAAAAGAAGTTAAGGGAGGCTGTCGTTGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791140.1
MDSIPHFDEVDNMEKAVDDEVDVSQVKAHGKQPSVEASTNSVALKKPRNIGRLDLIYQKLPNAKSSKTSQSQFEEAQKKLREAVVEKFTRWMYDAGISFNAVQYDSFKPMIEAIGQYGPGMKPPSFHEVRVPYLKKEIEHTKLILKEHEEQKVKYGCTLMSDGWRDKKGRSLINFLVNTLKRSMFAKSVDASEYSHTGMKMFELLDKFVQEVGENHVVQVVTDSASNNVYAGKLLEEKYKHIFWSPCAAHCLDLMFEDIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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