当前解析结果
SmilChr02G001648| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001648 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001648 |
| 描述 | MLO-like protein 11 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 30577969 - 30585793 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131013294 |
|---|---|
| GeneID | 131013294 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013294 |
| 原始查询 | SmilChr02G001648 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MLO-like protein 11 |
| 产物 | MLO-like protein 11 |
| Arabidopsis | AT5G53760 (MLO11)Seven transmembrane MLO family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835457] identity=67.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os11g0181400 (OsMLO11)- identity=44.9; qcov=0.932; evalue=4.59e-157; confidence=medium |
| GO | GO:0006952 (defense response); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03094 (Mlo) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013294 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057797346.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057797346.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797346.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797346.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797346.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:30579854 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,C60 |
Chr2:30579982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B83 |
Chr2:30580197 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr2:30582803 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr2:30584309 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr2:30584333 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B102,B118,C49 |
Chr2:30584343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,A19,B114,B137 |
Chr2:30584844 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B83,C72 |
Chr2:30585262 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C72,D2 |
Chr2:30585292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:30585385 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B3,B31,B40 |
Chr2:30585405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B46,B53 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057797346.1PF03094
Mlo 14-472 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057797346.1 |
Pfam | PF03094 |
Mlo | Family | 14 | 472 | 5e-169 | 563.4 | Mlo family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。