当前解析结果
SmilChr02G001656| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001656 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001656 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 30728396 - 30728923 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008276 |
|---|---|
| GeneID | 131008276 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008276 |
| 原始查询 | SmilChr02G001656 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=35.9; qcov=1.03; evalue=5.84e-34; confidence=medium |
| Rice | gene-orf490 (orf490)- identity=39; qcov=1.01; evalue=7.55e-38; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008276 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791146.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057791146.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791146.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791146.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791146.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:30728467 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 25 | A13,A25,A6,B105,B128,B129,B21,B45,B47,B49,B57,B60,B73,B79,B8,B81,C15,C29,C31,C35,C39,C4,C47,C63,C76 |
Chr2:30728477 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B44,B66,C45 |
Chr2:30728506 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr2:30728508 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B28,C1,C57,C70 |
Chr2:30728543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,B8,B88,C22 |
Chr2:30728556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B36,C5,C54 |
Chr2:30728569 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr2:30728583 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B36,C5,C54 |
Chr2:30728595 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C17,C30 |
Chr2:30728605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B45,B66 |
Chr2:30728606 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B53,D10 |
Chr2:30728622 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A23,B35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。