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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001659`

染色体: Chr02 坐标: 30775413-30777799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001659`
名称	SmilChr02G001659
描述	uncharacterized SmilChr02G001659
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30775413 - 30777799 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013301`
GeneID	`131013301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013301`
原始查询	`SmilChr02G001659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=26.8; qcov=0.806; evalue=2.1e-56; confidence=low
Rice	`Os06g0658400` - identity=56.8; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797355.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797355.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797355.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797355.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30775613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C72
`Chr2:30775616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr2:30775642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B27,B28,B44,C80
`Chr2:30775643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr2:30775646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C2
`Chr2:30775661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B89
`Chr2:30775663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B113
`Chr2:30775688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A9,B113,B133,B19,B28,B40,B6,B63,B95,C12,C25,C32,C58,C68
`Chr2:30775718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:30775747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C87
`Chr2:30775747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C87
`Chr2:30775753`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B14,B16,B69,C46,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797355.1

653 aa

326

653

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF04937 DUF659 113-277 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 501-580 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797355.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	113	277	3e-51	173.7	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057797355.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	501	580	7.5e-12	45.6	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941372.1
ACCTTCGAGTTCAAATGCCGAACGTGGACGTAAGCCTTTATGGAGATATGTCAAAATATCTAATACCGGAGGAGGCAACAATGGTGAGGTGAATTGGGAATGTAATTTTTGCCACACGCAAAAGAAGACAACATACACCCGAGTTGTGAAACACTTATTGAAGCAAGGTGGGGGGATCAAGGCTTGCCCCAAAGTAACACAACAAGATATGGATGAGATGCGTAAACTGATTGAGGAAGAGGAGAAAAGACAACTTATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013301
ATGGATGAGATGCGTAAACTGATTGAGGAAGAGGAGAAAAGACAACTTATCAACACTCCCAAAAATATCCCATTGCCACCTACTGCTACAAGATTTATGTCGGATGTTTACAAGGGATATGATGATTCGTCATTGTCAAAGAAGAGAAAGGGAAGTGACAATGATTCGTCGTCCCCTCTTGGCAAAGCTTTCAACATTCAAGGACGCAATACCTTGAATGCATTGATTGCAAGGTTCTTTTATGCATCGGGCTTGCCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797355.1
MDEMRKLIEEEEKRQLINTPKNIPLPPTATRFMSDVYKGYDDSSLSKKRKGSDNDSSSPLGKAFNIQGRNTLNALIARFFYASGLPFHLARSPYYAASYAYAANHNLPGFVPPGYNLLRTSLLQQEKANVERLLQPIKSTWREKGVSIVSDGWSDSQRRPLINFMAVTESGPMFLKAVDCSGEIKDKTFIFNLMREVIEEVGPQNVVQVITDNARNCAAAGALVEGLYPTIVWTPCVVHTLNLALQNICAAKNIENNQET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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