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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001667`

染色体: Chr02 坐标: 30944948-30946979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001667`
名称	SmilChr02G001667
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30944948 - 30946979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008281`
GeneID	`131008281`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008281`
原始查询	`SmilChr02G001667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=27; qcov=0.922; evalue=3.15e-33; confidence=low
Rice	`Os02g0202800` (OJ1135_F06.10-2) - identity=29.1; qcov=0.922; evalue=5.33e-40; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008281

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791152.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791152.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791152.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791152.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30945758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B5,C31,C60
`Chr2:30945835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C25
`Chr2:30945980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr2:30945983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C87
`Chr2:30946114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B140,B65
`Chr2:30946155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B16,B21,C28
`Chr2:30946160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B21,B80
`Chr2:30946172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B122,C4,C47
`Chr2:30946174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B97,C59,C62,C83
`Chr2:30946180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C80
`Chr2:30946191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C68
`Chr2:30946193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B21,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791152.1

321 aa

160

321

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 42-135 aa PF10551 MULE 257-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791152.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	42	135	5.8e-13	50.1	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057791152.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	257	321	4.7e-12	46.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935169.1
AATATATTCTCTATTATTAAAACCGAAAAGGGTAAATTAGGCACAAGCAATTTTCGGCCAGCATGTTTTAAGGGAAACAAATCTTAATTTATCTATTTTTATTTGGTAAGATTTGATTCTCAATATCCATTCCAATCTCTTCTACCGTAAATTCTTCTAACGTAAATTCTTCTTCTGTAAAATCTTATATTCTAAAAACTCTTCATCTCCGTATTATACCAAAAACCTGTAAGTCTGGGAAGCTTCAAGTCGGCGGCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008281
ATGGAGGATTTAGAATATCCGGCGTCTTTAGAAGATGAAACAATTGAACTTGTATTTCCGGAATGTGATGCTAAAAGCAAACCGTTTGAGGGGCAGATATTTCCAAATCTACAATTAGCATGTCAATTCTACAAAGACTATGCAAAACTATGTGGCTTTGCAGCCAGAAAAAGTACAAGCACAAAAGTTGATGGTACAATTGTAACATACTATATGTTATGCAATAGAGAAGGCCATCCTCCTGTACCAGATGTGTTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791152.1
MEDLEYPASLEDETIELVFPECDAKSKPFEGQIFPNLQLACQFYKDYAKLCGFAARKSTSTKVDGTIVTYYMLCNREGHPPVPDVLLMPESGSSIKKRKKTSCKVKCMARIIFQYLDLGVYKVRTFNEGHNHTMVPTVSRHLMPVNRTVTPVHQMWITSAIKARIGPMRSFRMYREIVDKYEDIGCTSDDFKNFAHELYVYALDSDAHMILETFKNKKELGNGFQYFYEVDDENRLIRLIWTDETSIRNYKLFGEDVSFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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