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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001669`

染色体: Chr02 坐标: 30949147-30954208 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001669`
名称	SmilChr02G001669
描述	uncharacterized SmilChr02G001669
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30949147 - 30954208 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008283`
GeneID	`131008283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008283`
原始查询	`SmilChr02G001669`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=23.4; qcov=0.184; evalue=9.9e-09; confidence=weak
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791154.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057791154.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791154.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791154.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791154.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30949656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr2:30949665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:30949839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B83,C14,C24
`Chr2:30949900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B52,B69,B88,B91,B99
`Chr2:30949956`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B22,B31,B44,B59,C32,D5
`Chr2:30950208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:30950214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:30950439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C64
`Chr2:30950493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:30950494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,D10
`Chr2:30950576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B35,B87
`Chr2:30950584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791154.1

950 aa

475

950

DUF8566

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 97-298 aa PF02902 Peptidase_C48 817-941 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791154.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	97	298	1.3e-49	169.5	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057791154.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	817	941	1.6e-05	25.6	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935171.1
CCGTCTTGAAGAAGTTTTGAACAGTCACCAAAAATTCACTTCATCTTCCACGATTCTCACGGTAGCTAGGGTTTCTCCCGGTTTGCTTTGAGCAGACGGCGACGGCGGCGCCTATCCAGGTATTTTGAATACAATGGCTCGTACGAAGGGTAAAGGAAAGGCTGTCGATGCTGGCACCTCACGCGTTAAAAAAACAAAAAAGGTAGTGCAAGGATCGTCCTCTGGCCCACCCACAAAGAGACTGAAAGTGGGCGAATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008283
ATGGCTCGTACGAAGGGTAAAGGAAAGGCTGTCGATGCTGGCACCTCACGCGTTAAAAAAACAAAAAAGGTAGTGCAAGGATCGTCCTCTGGCCCACCCACAAAGAGACTGAAAGTGGGCGAATCATCCGGAGTGAAGAATGTGGAAGATGGTTCCGAAAGCCCAAAAGTAAAGAAGCTAAAGAGAAAGGAATTTGCAATTCCAAACGAGGTGAAGTGTCGTCGACGGATTAAGAACACCGAAGATGGTCCAGATGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791154.1
MARTKGKGKAVDAGTSRVKKTKKVVQGSSSGPPTKRLKVGESSGVKNVEDGSESPKVKKLKRKEFAIPNEVKCRRRIKNTEDGPDAKKKTDHPRLKTRTTTCTFFKKLTVLNEAQKDAVRSIGFGHILEFKVNRVPSELAYWVLDRFNHRSCTLELDVLTKVEIEEDDVYRVYGFPKGNKLIENFERTAENELFIEWKNFFNVANRDKIKIKAVLRRMVDSADGGTWFKRHFVIALCFSLMESCTSGTVHPYIFSALANI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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