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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001685`

染色体: Chr02 坐标: 31091839-31092639 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001685`
名称	SmilChr02G001685
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31091839 - 31092639 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008292`
GeneID	`131008292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008292`
原始查询	`SmilChr02G001685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.9; qcov=1.03; evalue=1.37e-42; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=33.3; qcov=0.406; evalue=2.15e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791163.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791163.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791163.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791163.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31091840`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B124,B18,B33,B36,B79,B86,B87,C16,C56
`Chr2:31091883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C80
`Chr2:31091885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:31091908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B89,C50,D10
`Chr2:31091919`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A1,A10,A22,B10,B101,B105,B109,B137,B140,B22,B25,B3,B89,B92,C10,C13,C2,C24,C36,C4,C47,C49,C5,C50,C58,C59,C6,C7,C71,C72,C79,C83,D10,D3,D5
`Chr2:31091922`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B105,B89,B92,C50,C6,D10
`Chr2:31091925`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A1,A10,A22,B10,B101,B109,B137,B140,B22,B25,B3,C10,C13,C2,C24,C36,C4,C47,C49,C5,C58,C59,C7,C71,C72,C79,C83,D3,D5
`Chr2:31091935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr2:31091936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr2:31091944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr2:31091945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C50,D10
`Chr2:31091955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791163.1

266 aa

133

266

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 226-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791163.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	226	266	7e-09	37.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935180.1
ATGAGCTGTTTTAGGGTGCCTGCTGCGGTTTGCAATGATATTGAAAGAGAGTGCTGTAATTTTTGGTGGGGTAATGAGGGAGATAGGAAGCTAATGCATTGGTCTTCGTGGAAGAATCTTTGCGCCCCAAAATCCAAAGGTGGAGTGGGATTTCGTCGTCTTGAGTCTTTTAATAGGGCGCTTCTGGCGAAGCAGGCGTGGAGATTGATTAAATTTCCGAACTCCCTAGTGGCCAGACTGCTCAAAGGTAGATACTACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008292
ATGAGCTGTTTTAGGGTGCCTGCTGCGGTTTGCAATGATATTGAAAGAGAGTGCTGTAATTTTTGGTGGGGTAATGAGGGAGATAGGAAGCTAATGCATTGGTCTTCGTGGAAGAATCTTTGCGCCCCAAAATCCAAAGGTGGAGTGGGATTTCGTCGTCTTGAGTCTTTTAATAGGGCGCTTCTGGCGAAGCAGGCGTGGAGATTGATTAAATTTCCGAACTCCCTAGTGGCCAGACTGCTCAAAGGTAGATACTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791163.1
MSCFRVPAAVCNDIERECCNFWWGNEGDRKLMHWSSWKNLCAPKSKGGVGFRRLESFNRALLAKQAWRLIKFPNSLVARLLKGRYYRNGDMMDAIPPCNASFSWRSICWGGGLLRKGIRWRIGNGTGVRAFVDPWIPMEGGGGRGSGSEGDGVRVADFLRDDGGWNQQKLESSFLPHEVAAVLNIDRESRKEEDVRFWRYDEKGRYTVKSGYLLETGFYDGHDSTSSSETKRWWSHIWNINVPPKVRVFMWRATSNFIPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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