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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001690`

染色体: Chr02 坐标: 31159543-31170581 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001690`
名称	SmilChr02G001690
描述	vesicle-fusing ATPase
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31159543 - 31170581 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013319`
GeneID	`131013319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013319`
原始查询	`SmilChr02G001690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-fusing ATPase
产物	vesicle-fusing ATPase
Arabidopsis	`AT4G04910` (NSF) AAA-type ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825830] identity=82.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0519400` (OsSec18) - identity=76.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005795 (Golgi stack); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0035494 (SNARE complex disassembly); GO:0043001 (Golgi to plasma membrane protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF02933 (CDC48_2); PF07728 (AAA_5); PF17862 (AAA_lid_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797375.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797375.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057797375.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797375.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31162897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:31168030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797375.1

638 aa

319

638

CDC48_2

AAA_5

AAA

AAA_lid_3

AAA

PF02933 CDC48_2 18-61 aa PF07728 AAA_5 151-227 aa PF00004 AAA 151-291 aa PF17862 AAA_lid_3 318-354 aa PF00004 AAA 432-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797375.1`	Pfam	`PF02933`	CDC48_2	Domain	18	61	6.6e-07	29.6	Cell division protein 48 (CDC48), domain 2
`XP_057797375.1`	Pfam	`PF07728`	AAA_5	Domain	151	227	1.1e-08	35.9	AAA domain (dynein-related subfamily)
`XP_057797375.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	151	291	5.4e-51	173.2	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057797375.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	318	354	1.9e-11	44.0	AAA+ lid domain
`XP_057797375.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	432	558	5.4e-51	173.2	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941392.1
AACGATCCGTCATGACTTATTAGCGAAGGAAAAGATCCATATAGAATAAAAAACGTTGAACTGAAGAAGAGGGAAGGAAGGAACCTTGATTTCTGAGATAGTATTATTGCATTTAAAATCGTAACAATTTCAAATATTTACACAAGTCGGATCTCATTTTCGATTAGCGAATCGGGACGATGGCGCCGACGATGATTGTGACGAATACGCCGGCGAAAGATCTCGCTTACACCAATTTCGCCTACTGCTCCCCCGCTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013319
ATGCTGAGACTTGAGTTAGAGTTTGTGAAGAAGGGGGCAAGAGATGAACAGGTGGATGCTGTTCTTTTATCCCAGCAAATCCACAAGAGATTCATGAACCAGGTTATGACAATTGGGCAGAGGGTAACATTTGAGTATCATGGCAATGGATATATCTTCACTGTCACTGAAGCTACTGTGGGGGAAGAAAAATCTTATGGTATGGAGAGGGGGTTGATATCACCTGACACATTCATTGTATATGAAGCATCAAATTCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797375.1
MLRLELEFVKKGARDEQVDAVLLSQQIHKRFMNQVMTIGQRVTFEYHGNGYIFTVTEATVGEEKSYGMERGLISPDTFIVYEASNSSGIKIVNQREGTNSNIFRHKEFNLQSFGIGGLSAEFADIFRRAFASRVFPAHVTSKLGIKHVKGMLLYGPPGTGKTLMARQIGKMLNGKEPKIVNGPEVLSKFVGETEKNVRDLFADAEQDQRTKGDQSELHIIIFDEIDAICKSRGSTRDGTGVHDSIVNQLLTKIDGVESLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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