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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr02G001695

染色体: Chr02 坐标: 31238042-31239698 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr02G001695
名称SmilChr02G001695
描述uncharacterized SmilChr02G001695
染色体 / SeqIDChr02 / NC_080388.1
坐标与链方向31238042 - 31239698 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131013323
GeneID131013323
locus_tag-
NCBI NameLOC131013323
原始查询SmilChr02G001695

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841737]; symbol=AT1G53035; hit=AT1G53035; species=arabidopsis; confidence=high
产物uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841737]; symbol=AT1G53035; hit=AT1G53035; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT1G53035 (AT1G53035)
uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841737]
identity=61.1; qcov=1; evalue=5.01e-63; confidence=high
Rice-
-
GO-
KEGG-
PfamPF25266 (DUF7865)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131013323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum 内质网 1.00000 XP_057797378.1
2 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 1.00000 XP_057797378.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057797378.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057797378.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057797378.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797378.1
144 aa
N
1
72
144
DUF7865
C
PF25266 DUF7865 1-132 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057797378.1 Pfam PF25266 DUF7865 Domain 1 132 1.2e-66 223.5 Domain of unknown function (DUF7865)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057941395.1
TTCCCTTCAATTCAGATAATCTGTACAGAAAATTAAAGAGAGCTGGCCCCATTAACAAATTTATTTATGGATTCTTCAATTCTTTTTATTATCCCAAAATTGTGGCCCGATTGATTTTGGATCTTTTGTCTTCTGTTTTGGGCACAAACTAATCGAAATATAGCGGCTGATTAGCTGTAAAAACGAGCATTAACAGCAAAATCTGCACAAGCGCTTACATTTTTTTTGGGTCACAAAACTTTCCTTATTTCATCAATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131013323
ATGGTGTCATCTGGGTTTTTCCTAATTTGTATGCTCCATTCTTTGGTGGCCTTGTCATGTGGAGCCATGATGATGTTCTATAGGGATGAGGTGTTTGTGTTTAGCCATGGTAAGGACCATGCTAGTAAGCTTTTGGGCTCAACACCTCATGATCAGCTCTTGATTCGAACCTCTGATTCGTTTTCGGGTTTACTTTTATTCGCTGTTGGGCTCTTGTTGTTCATGGTGGCGTTTGTGAAGGAGAAGGAGTTCCATGGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057797378.1
MVSSGFFLICMLHSLVALSCGAMMMFYRDEVFVFSHGKDHASKLLGSTPHDQLLIRTSDSFSGLLLFAVGLLLFMVAFVKEKEFHGFFARGCVVLHIAMAIWRIYFERKVEDLGHDWLRLVFGDIILGLSWVLFLVYSWREKYD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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