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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001696`

染色体: Chr02 坐标: 31239220-31241502 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001696`
名称	SmilChr02G001696
描述	uncharacterized SmilChr02G001696
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31239220 - 31241502 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008297`
GeneID	`131008297`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008297`
原始查询	`SmilChr02G001696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=24.2; qcov=0.727; evalue=3.63e-11; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.4; qcov=0.543; evalue=6.86e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008297

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791167.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791167.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791167.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791167.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31239272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:31239299`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A20,A22,A6,A8,B1,B107,B110,B115,B118,B121,B132,B18,B19,B22,B25,B3,B31,B32,B37,B40,B41,B49,B54,B59,B6,B60,B63,B68,B7,B75,B86,B9,B99,C10,C26,C28,C35,C41,C45,C51,C6,C60,C63,C7,C75,C76,C87,D11
`Chr2:31240723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:31240734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D3
`Chr2:31240758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C74
`Chr2:31240778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B126,B29,B78
`Chr2:31240778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B29,B78
`Chr2:31240884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:31240887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,D10
`Chr2:31240923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,D11
`Chr2:31240955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,C2,C32,C68
`Chr2:31240981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791167.1

363 aa

182

363

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 165-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791167.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	165	259	1.7e-19	71.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935184.1
ATGATTGAGCAAAGCCAAACAAAATCAAGAAACAGCTCAAATTCAAGATTCAGATGGCAAAATATTGATATTAAAAGATCAAAAATTACCTGTTCAACGAACTTTCTGGATCCCAGACTGAGGCTTCTACAGAGAGATGATGGAAGGAATTCGATAAGAGAGAAAGATCCAAGAACTGTTTTTGGGTCCAAAACCCTGAGACTTATGTTGATTCTTTTGTCTACAAAATTCTGGGATCACAAGTGGGCGGGGTCGTTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008297
ATGATTGAGCAAAGCCAAACAAAATCAAGAAACAGCTCAAATTCAAGATTCAGATGGCAAAATATTGATATTAAAAGATCAAAAATTACCTGTTCAACGAACTTTCTGGATCCCAGACTGAGGCTTCTACAGAGAGATGATGGAAGGAATTCGATAAGAGAGAAAGATCCAAGAACTGTTTTTGGGTCCAAAACCCTGAGACTTATGTTGATTCTTTTGTCTACAAAATTCTGGGATCACAAGTGGGCGGGGTCGTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791167.1
MIEQSQTKSRNSSNSRFRWQNIDIKRSKITCSTNFLDPRLRLLQRDDGRNSIREKDPRTVFGSKTLRLMLILLSTKFWDHKWAGSLPLKLVFPRLYLLSANKEALISESGFWENGGWKWDLSWRRELFERDKRGVHDLLSFISGTNLVAGVPDEWSWSAAKDGLYLTKSAYEAIKETRQERRTSEAINEILSKVWKSPVPLKVRVMAWRTLRDRLPTCANLRRRNIALNEVDTGCNACFHSEETINHLLFHCPKTEKVWD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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