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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001708`

染色体: Chr02 坐标: 31428694-31429842 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001708`
名称	SmilChr02G001708
描述	uncharacterized SmilChr02G001708
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31428694 - 31429842 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008299`
GeneID	`131008299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008299`
原始查询	`SmilChr02G001708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745990]; symbol=AT5G18636; hit=AT5G18636; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745990]; symbol=AT5G18636; hit=AT5G18636; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G18636` (AT5G18636) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745990] identity=23.9; qcov=0.623; evalue=4.44e-19; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=30.1; qcov=0.487; evalue=9.24e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791170.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791170.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791170.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791170.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31428705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B2,C27
`Chr2:31428705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C27
`Chr2:31428710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A23,B64,C29
`Chr2:31428721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B65
`Chr2:31428727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A9,B122,B65,C48
`Chr2:31428728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:31428734`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B122
`Chr2:31428734`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr2:31428735`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr2:31428735`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr2:31428750`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B65
`Chr2:31428750`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791170.1

382 aa

191

382

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 28-103 aa PF14392 zf-CCHC_4 168-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791170.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	28	103	5.5e-17	62.0	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057791170.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	168	213	3.3e-16	59.4	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935187.1
ATGGTCGGCCTCACCCTCTCTAATGAAGATGACGAACTATTGCTCGATGATGCTGTTACCGGGGAGTCTTCTGTGGACGTCGATCTTTGTCTGGTGGGGAAGTTCATTACGGATCAACCGATCAATTTCAATTTAATGTGTAGCCGTTTAGCCAGTATTTGGCGTCCGGGAAAAGGCGTCTTTATGAAAGATATTGGTGAAGGAAGATATATATTCCAATTCTTCCATGAAGTGGATCTGATGAGAGTCCATGAAGGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008299
ATGGTCGGCCTCACCCTCTCTAATGAAGATGACGAACTATTGCTCGATGATGCTGTTACCGGGGAGTCTTCTGTGGACGTCGATCTTTGTCTGGTGGGGAAGTTCATTACGGATCAACCGATCAATTTCAATTTAATGTGTAGCCGTTTAGCCAGTATTTGGCGTCCGGGAAAAGGCGTCTTTATGAAAGATATTGGTGAAGGAAGATATATATTCCAATTCTTCCATGAAGTGGATCTGATGAGAGTCCATGAAGGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791170.1
MVGLTLSNEDDELLLDDAVTGESSVDVDLCLVGKFITDQPINFNLMCSRLASIWRPGKGVFMKDIGEGRYIFQFFHEVDLMRVHEGGPWSFGNFPLILHRLKRGEFPLNVPLDTLPFWIQVHDLPAGYLTEGVGRLLGNFIGTFMEYDSTNSVGVWRQFMRIRVGVRVADPLKRFKKLKSKDGSSFVVNFKYERLNVFCFLCGRLGHSEYFCELMFNSTSKTAVREWGVGLKAADRRGMNLAGDRWLRNEDASVNPSTEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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