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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001731`

染色体: Chr02 坐标: 31799366-31799905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001731`
名称	SmilChr02G001731
描述	uncharacterized SmilChr02G001731
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31799366 - 31799905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008305`
GeneID	`131008305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008305`
原始查询	`SmilChr02G001731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0629687; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0629687; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G65005` (AT5G65005) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922371] identity=27.9; qcov=0.782; evalue=5.3e-06; confidence=low
Rice	`Os06g0629687` - identity=35.2; qcov=0.492; evalue=3.34e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791176.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791176.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791176.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057791176.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31799399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B92,C54,C66
`Chr2:31799501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:31799519`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B118,B27,B47,C5
`Chr2:31799519`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B118,B27,B47,C5
`Chr2:31799566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:31799578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20
`Chr2:31799578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:31799586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A1,C61
`Chr2:31799586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C61
`Chr2:31799632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr2:31799633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:31799683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791176.1

179 aa

179

RVT_3

PF13456 RVT_3 35-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791176.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	35	154	1.3e-23	84.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935193.1
ATGATAGCGCAGCGAGCTGTTTGCTCGAAACCTTTACCTGATCACCTATCGCTTGCCAGAAACCTTACTCTCAAGTGTTCTCGTGACTCTCAGTTCAAGATTAATTGTGATGCAGCGATTGATGTGGGACGTGGCTTTGGCTTTGGTGTGGTGAGCACGAACAAGGATGGGATGTTGGTGGGTGGTCGTCAGGGTTTTATCCCGGGGTTTTACTCGGCGGAAGAAGGCGAGGCTAGAGCGATTCTTGAAGGCCTGATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008305
ATGATAGCGCAGCGAGCTGTTTGCTCGAAACCTTTACCTGATCACCTATCGCTTGCCAGAAACCTTACTCTCAAGTGTTCTCGTGACTCTCAGTTCAAGATTAATTGTGATGCAGCGATTGATGTGGGACGTGGCTTTGGCTTTGGTGTGGTGAGCACGAACAAGGATGGGATGTTGGTGGGTGGTCGTCAGGGTTTTATCCCGGGGTTTTACTCGGCGGAAGAAGGCGAGGCTAGAGCGATTCTTGAAGGCCTGATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791176.1
MIAQRAVCSKPLPDHLSLARNLTLKCSRDSQFKINCDAAIDVGRGFGFGVVSTNKDGMLVGGRQGFIPGFYSAEEGEARAILEGLIMCKDKGLEDIIIETDCQSLFWRLQNRKEDRSSLGDSVDKIISLAASFGCCSFSWTPREGNYIADCLAKVSLLNRVAQFVSEVSLLFLNSLLAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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