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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001742`

染色体: Chr02 坐标: 32017537-32018340 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001742`
名称	SmilChr02G001742
描述	uncharacterized SmilChr02G001742
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32017537 - 32018340 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013365`
GeneID	`131013365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013365`
原始查询	`SmilChr02G001742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0768600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0768600` - identity=39; qcov=0.752; evalue=4.6e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797412.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797412.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797412.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797412.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32017755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:32017791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	176	A1,A13,A14,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B16,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B51,B52,B54,B55,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B68,B69,B7,B70,B73,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B87,B9,B91,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C21,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C64,C65,C67,C69,C7,C73,C74,C75,C77,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D4,D8,D9
`Chr2:32017821`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	175	A1,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B103,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B131,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B19,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B60,B61,B62,B65,B67,B68,B69,B70,B73,B76,B77,B78,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C20,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C36,C38,C4,C43,C44,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C82,C85,C86,C87,D1,D2,D3,D5,D6
`Chr2:32017874`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B108,B81
`Chr2:32017874`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B108,B81
`Chr2:32017944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B98
`Chr2:32017952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:32017974`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A11,A19,A3,B101,B108,B127,B20,B23,B35,B42,B43,B53,B64,B66,B71,B74,B78,C2,C24,C32,C36,C40,C42,C46,C50,C68,C72,D5
`Chr2:32017992`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B104,B32,B37,B41,B48,B6,C12,C63,C71,D11
`Chr2:32018010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A24
`Chr2:32018010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:32018016`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797412.1

218 aa

109

218

DUF4216

PF13952 DUF4216 83-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797412.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	83	151	2.1e-17	64.1	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941429.1
CATGTTGACATGCTTGAGGAGGACCCAATATCTCGGGATTTGAAATTGTTTGCCGATGGACCAGACATCATTGGAGTTTCCTACGAAAGATATGTTGTAAATGGTTTTCGATTTCATACTAGCGAATTGGAGCACAAAAGAAAAACACAAAACAGCGGAATATCTGTGAAAGTAGCGACATCAAGCTATTCTAGCACACGAGATGAAAATCCTATACTAAGTGAGTTGGATTATTATGGAGTTTTAACTGAGATCATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013365
ATGCTTGAGGAGGACCCAATATCTCGGGATTTGAAATTGTTTGCCGATGGACCAGACATCATTGGAGTTTCCTACGAAAGATATGTTGTAAATGGTTTTCGATTTCATACTAGCGAATTGGAGCACAAAAGAAAAACACAAAACAGCGGAATATCTGTGAAAGTAGCGACATCAAGCTATTCTAGCACACGAGATGAAAATCCTATACTAAGTGAGTTGGATTATTATGGAGTTTTAACTGAGATCATTGAACTACGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797412.1
MLEEDPISRDLKLFADGPDIIGVSYERYVVNGFRFHTSELEHKRKTQNSGISVKVATSSYSSTRDENPILSELDYYGVLTEIIELRYVNRQVVLFGCDWVSKGKRLKQNINGFTIANFTNIIRHEEPFILSSQATQVFHVGDPVDTDWHVVISTRARGVYNMEPLADVKKPICKAISVVLQFKMTLKKSIGYVKIWKELKLTFFLEDFVIGVFCSSDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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