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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001746`

染色体: Chr02 坐标: 32044164-32045585 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001746`
名称	SmilChr02G001746
描述	protein yippee-like At5g53940
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32044164 - 32045585 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013368`
GeneID	`131013368`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013368`
原始查询	`SmilChr02G001746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein yippee-like At5g53940
产物	protein yippee-like At5g53940
Arabidopsis	`AT5G53940` (AT5G53940) Yippee family putative zinc-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835477] identity=57.9; qcov=0.776; evalue=1.56e-23; confidence=medium
Rice	`Os03g0698500` - identity=52.7; qcov=0.561; evalue=1.3e-17; confidence=low
GO	GO:0000151 (ubiquitin ligase complex)
KEGG	-
Pfam	PF03226 (Yippee-Mis18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013368

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797419.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797419.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797419.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057797419.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32044742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797419.1

118 aa

118

Yippee-Mis18

PF03226 Yippee-Mis18 14-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797419.1`	Pfam	`PF03226`	Yippee-Mis18	Domain	14	106	9.6e-14	52.2	Yippee zinc-binding/DNA-binding /Mis18, centromere assembly

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941436.1
AAAATAAATTGAAAGAGAAAAGGGTGGTAAGATGGGGCGAGAGGCCCAATAGAAAAAGAAACCACGTGTCAGTGTCATACTGATTGGTGGGTCGGGTCGGGGCATGGGGTTGTCCAAATTCATTAATTGTCCCATCCATATCCTATATCGTCGCAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAAGGATATTCGTGGTTGATTTGGAAGGAAGATCCTACAGATGCAAATTCTGCAAAACCCAGCTAGC...

XM_057941438.1
TAATTGTCCCATCCATATCCTATATCGTCGCAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGGAAGGATATTCGTGGTTGATTTGGAAGGAAGATCCTACAGATGCAAATTCTGCAAAACCCAGCTAGCACTTGCTGATGAACTTATTTCCCGGGCGTTTCACTGCCGAAGGGGGAAGGCGTACCTTTTTAATAATGTGAGACCGCCCACGAGGAGAGCCAGAAATATAAACAAGGGAAATTTGCTCTTGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013368
ATGGGAAGGATATTCGTGGTTGATTTGGAAGGAAGATCCTACAGATGCAAATTCTGCAAAACCCAGCTAGCACTTGCTGATGAACTTATTTCCCGGGCGTTTCACTGCCGAAGGGGGAAGGCGTACCTTTTTAATAATGTGAGACCGCCCACGAGGAGAGCCAGAAATATAAACAAGGGAAATTTGCTCTTGAGAGAGATGGAATCACAGACGGAGAGGATTCCGAATTCTGCATCGCCTTTCTATGAGAGAGTGAAGAT...

LOC131013368
ATGGGAAGGATATTCGTGGTTGATTTGGAAGGAAGATCCTACAGATGCAAATTCTGCAAAACCCAGCTAGCACTTGCTGATGAACTTATTTCCCGGGCGTTTCACTGCCGAAGGGGGAAGGCGTACCTTTTTAATAATGTAGTGAATGTGACAGTTGGACCTCATGAGGAAAGGATGATGATTTCTGGGATGCATACTGTATCAGATGTATTTTGCTGCTCTTGTGGGCAGTTACTAGGCTGGAAATATGAGACCGCCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797419.1
MGRIFVVDLEGRSYRCKFCKTQLALADELISRAFHCRRGKAYLFNNVVNVTVGPHEERMMISGMHTVSDVFCCSCGQLLGWKYETAHEESQKYKQGKFALERDGITDGEDSEFCIAFL

XP_057797421.1
MGRIFVVDLEGRSYRCKFCKTQLALADELISRAFHCRRGKAYLFNNVRPPTRRARNINKGNLLLREMESQTERIPNSASPFYERVKMKIWLWFICICR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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