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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001755`

染色体: Chr02 坐标: 32294007-32297517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001755`
名称	SmilChr02G001755
描述	D-amino-acid transaminase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32294007 - 32297517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012427`
GeneID	`131012427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012427`
原始查询	`SmilChr02G001755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-amino-acid transaminase, chloroplastic
产物	D-amino-acid transaminase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G57850` (ADCL) D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835895] identity=58.1; qcov=0.86; evalue=8.87e-117; confidence=high
Rice	`Os01g0238500` - identity=62.3; qcov=0.948; evalue=5.02e-147; confidence=high
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0019752 (carboxylic acid metabolic process)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01063 (Aminotran_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796363.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796363.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796363.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796363.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32295579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:32295923`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B40
`Chr2:32295923`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B40
`Chr2:32295945`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B83
`Chr2:32295945`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B83
`Chr2:32296141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B40,B48
`Chr2:32296262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,D11
`Chr2:32296272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A14,A9,B123,B136,B3,B47,B51,B62,B77,C18,C23,C3,C39,C65,D1
`Chr2:32296356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:32296467`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C36
`Chr2:32296467`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C36
`Chr2:32296540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B1,B35,B40,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796363.1

344 aa

172

344

Aminotran_4

PF01063 Aminotran_4 78-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796363.1`	Pfam	`PF01063`	Aminotran_4	Domain	78	302	6.8e-34	118.4	Amino-transferase class IV

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940380.1
GTCGTAAAGCAGTATCTTTCCATCAATAAAACTGCAGTATTTTCTGCATATTCTTTCAGTAGCACACTCTATTTCCAAATATATATTTTTTCGGCTATATATTTTCTGATCTTTTTGGTTAGATGGCAGCATCCGATTCTTGTTCTATGGTCGCGCCGGAGGCAGCAAATGGTGAAGAGTTTAAGGTTGAAGTTTTTGCATCGTCGTCGAAGTTATTGTCAAAGCTGCAAGAAAAATGGCCAGGGAAGCCAAAGCCTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012427
ATGGCAGCATCCGATTCTTGTTCTATGGTCGCGCCGGAGGCAGCAAATGGTGAAGAGTTTAAGGTTGAAGTTTTTGCATCGTCGTCGAAGTTATTGTCAAAGCTGCAAGAAAAATGGCCAGGGAAGCCAAAGCCTTATCCTGCAATGTATTCGAGTGTGTATGGTGGGATCCTTCTTGATTCGGCCATGATGGTCATCCCCATAGACGACCAGATGGTTAATCGAGGCCACGGTGTTTTTGACACGGCCATCATACTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796363.1
MAASDSCSMVAPEAANGEEFKVEVFASSSKLLSKLQEKWPGKPKPYPAMYSSVYGGILLDSAMMVIPIDDQMVNRGHGVFDTAIILNGYLYELDVHLARFLRSASNAKIVSPFPETTLRSILIQLAASSGCRNGTLRYWLSAGLGNFLLSPAGLTSSAFYAVVIDGGFLQCREGVKVITSSIPMKSPLFATMKNVNYLPNMLAKMEAEEERADASVWIDEEGCIAEGPNVNVAFITRDGELVLLAFDKILSGCSAMRLLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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