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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001778`

染色体: Chr02 坐标: 32561010-32566063 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001778`
名称	SmilChr02G001778
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32561010 - 32566063 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008317`
GeneID	`131008317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008317`
原始查询	`SmilChr02G001778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=33; qcov=0.592; evalue=3.41e-34; confidence=low
Rice	`Os05g0583100` - identity=37.4; qcov=0.537; evalue=2.75e-39; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14372 (hAT-like_RNase-H); PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791187.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791187.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791187.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791187.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32561030`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B10,B2,B30,C34,C79
`Chr2:32561030`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B10,B2,B30,C34,C79
`Chr2:32561165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	116	A1,A10,A11,A13,A18,A21,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B103,B105,B106,B111,B113,B118,B119,B120,B126,B127,B130,B132,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B33,B35,B37,B40,B44,B46,B47,B49,B50,B52,B58,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B71,B74,B78,B79,B82,B83,B85,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C17,C23,C27,C32,C34,C35,C36,C38,C4,C41,C5,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C65,C68,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C80,C81,C82,C84,C85,C87,D1,D4,D5
`Chr2:32561167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B40,C26
`Chr2:32561169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B113,B28,B5,B50
`Chr2:32561176`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B103,B64,C71
`Chr2:32561176`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B103,B64,C71
`Chr2:32561198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:32561205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:32561216`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A2,A3,B104,B109,B121,B122,B132,B18,B19,B26,B3,B6,C18,C28,C41,C47,C58,C61,C67,C9
`Chr2:32561232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B5,B50
`Chr2:32561271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A3,B104,B109,B121,B122,B129,B132,B18,B19,B26,B6,B89,B97,C18,C26,C28,C41,C47,C58,C61,C67,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791187.1

348 aa

174

348

ZBED1_RNase-like_helical

hAT-like_RNase-H

PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 112-183 aa PF14372 hAT-like_RNase-H 205-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791187.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	112	183	1.1e-13	51.9	ZBED1 RNase-like helical domain
`XP_057791187.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	205	297	5.7e-27	94.5	hAT-like transposase, RNase-H fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935204.1
ATGATGAAGAAATTGAGAGAGAAAGAGGATGAGAGGGGACGCAAGTGGAGACCAGAGCTGAACAACTCAGAGGCAGAGACCAGAGCAGAACAACTCAGACGTCAGAGCAGAAACCGGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGACAAGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGTAGCTCAGACCAGAGTAGAGACAAGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGCAGCTCCAAGTGCACAAGGTTTTCACCATCTCAGTGGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008317
ATGATGAAGAAATTGAGAGAGAAAGAGGATGAGAGGGGACGCAAGTGGAGACCAGAGCTGAACAACTCAGAGGCAGAGACCAGAGCAGAACAACTCAGACGTCAGAGCAGAAACCGGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGACAAGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGTAGCTCAGACCAGAGTAGAGACAAGAGCATCTCAGAGGCCAGAGCAGAGCAGCTCCAAGTGCACAAGGTTTTCACCATCTCAGTGGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791187.1
MMKKLREKEDERGRKWRPELNNSEAETRAEQLRRQSRNRSISEARAETRASQRPEQSSSDQSRDKSISEARAEQLQVHKVFTISVDNTSNNNVTIRIAKETFSRSRKLPLEESRLNKFSDVVHHLGISVKRMIIDCPTRWNSTYEMLLEAYRVRDVFHVFQQREPSCRFCPSIHDWMKVKDVVDILEVFYEATHVISGVDYPTSNVYLDVIWRVKHVLNDKENHVDEFIRVMIKKMKEKFDKYWESCNLLMAMGAILDPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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