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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001785`

染色体: Chr02 坐标: 32628923-32634187 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001785`
名称	SmilChr02G001785
描述	sodium/calcium exchanger NCL-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	32628923 - 32634187 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012035`
GeneID	`131012035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012035`
原始查询	`SmilChr02G001785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium/calcium exchanger NCL-like
产物	sodium/calcium exchanger NCL-like
Arabidopsis	`AT1G53210` (AT1G53210) sodium/calcium exchanger family protein / calcium-binding EF hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841755] identity=65.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0212400` (OsEFCAX1) sodium/calcium exchanger NCL1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325568] identity=61.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0015369 (calcium:proton antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01699 (Na_Ca_ex); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057795925.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057795925.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057795925.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795925.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:32631518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:32631533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:32632943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:32632984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,B95,C84
`Chr2:32632994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:32633336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B1,C30
`Chr2:32633451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:32633845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B93
`Chr2:32633964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795925.1

559 aa

280

559

EF-hand_7

Na_Ca_ex

PF13499 EF-hand_7 295-358 aa PF01699 Na_Ca_ex 406-550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795925.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	295	358	4.9e-09	37.1	EF-hand domain pair
`XP_057795925.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	406	550	2.2e-18	67.4	Sodium/calcium exchanger protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939942.1
TTTTTTTAATATTTTGGAAGCTGAAGAAGTAAGGGTACCCATGTGGCATGTGAAGAGTGGGATGGGGCAAGTTGATTTGGAATTTGTTGGATAGTTTACGCGCGTCCAACACTTTGATTTGTTTTAAGTCAAAAGGCTTCAAAGCCCTTTTAACAACACGGTTACACGGCCAAGACGCTGCGCTACATCATCATTATATATCTATCAGCTACACCAACACACACACTCGCACTCACACACTGCGATCCAACCGCCATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012035
ATGGCTGCTCCCCTCAAGCTCAAGCCCAAGCCCAATCTCCTCATCACCTTCCTCGTCTTCCTCATCCTCTGCGGCTGCGCCTACGCTCGCCTCATCTCCGATCCAGCGGATCTCATCTCGGACGGCGTCTCCGCTGCCCCCTTCCTGCGCCTCTACGCCGCAGATGAGGCCTGCGAGCAGACCTACGGCTTCATGCCGTGCACCAGCTCCGGGATCGGAAGCCTCTTCCTGATTCTGTTGTATGGATACCTCATGTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795925.1
MAAPLKLKPKPNLLITFLVFLILCGCAYARLISDPADLISDGVSAAPFLRLYAADEACEQTYGFMPCTSSGIGSLFLILLYGYLMFLAATYLSAGSELLLEMLGPGLVGGLFLPILGALPDALLILVSGLSGTPETAQSQVSVGMGLLAGSTVMLLTTAWGTCIIVGKCDLENSVAVDSTDTKGFSLTGSGVSTDIWTSYAGIIMAISVIPFVVVQLPQVLNIDSGRHLVVLIALIVSVGLLISYCLYQVFQPWIQKRRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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