当前解析结果
SmilChr02G001788| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001788 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001788 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001788 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 32653735 - 32655985 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012039 |
|---|---|
| GeneID | 131012039 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012039 |
| 原始查询 | SmilChr02G001788 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OsSPEAR2; symbol=OsSPEAR2; hit=Os01g0212500; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | OsSPEAR2; symbol=OsSPEAR2; hit=Os01g0212500; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os01g0212500 (OsSPEAR2)- identity=60; qcov=0.147; evalue=2.45e-08; confidence=weak |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012039 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057795929.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057795929.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057795929.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057795929.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057795929.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:32653864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B34,B82,B94 |
Chr2:32653892 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B37,B59,B84,C77 |
Chr2:32653922 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,A4,B104,B45,B96 |
Chr2:32654050 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B68 |
Chr2:32654519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B34,B82,B94 |
Chr2:32654951 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B94,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。